RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 MSANTD4Q8NCY6 345 aa18.48■□□□□ 0.55
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PACS1-201ENST00000320580 KCNK9Q9NPC2 374 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 ZNF174Q15697 407 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 CABLES1Q8TDN4 633 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 EYA1Q99502 592 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 PLIN2Q99541 437 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 TSC22D3Q99576 134 aa18.48■□□□□ 0.55
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PACS1-201ENST00000320580 KRT18P05783 430 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
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PACS1-201ENST00000320580 MMS19Q96T76 1030 aa18.47■□□□□ 0.55
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PACS1-201ENST00000320580 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
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PACS1-201ENST00000320580 SLC40A1Q9NP59 571 aa18.47■□□□□ 0.55
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PACS1-201ENST00000320580 EXOC1Q9NV70 894 aa18.47■□□□□ 0.55
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PACS1-201ENST00000320580 CYP27A1Q02318 531 aa18.46■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 PSMD2Q13200 908 aa18.46■□□□□ 0.55
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PACS1-201ENST00000320580 EHD4Q9H223 541 aa18.46■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 NFU1Q9UMS0 254 aa18.46■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 CDHR2Q9BYE9 1310 aa18.46■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 TFRCP02786 760 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 POLE2P56282 527 aa18.46■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 TAF11Q15544 211 aa18.46■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 CHRNA2Q15822 529 aa18.46■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa18.46■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PACS1-201ENST00000320580 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.46■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 PPP6R2O75170 966 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 SEC24CP53992 1094 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
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PACS1-201ENST00000320580 B4E1Z4 1266 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 BUB1O43683 1085 aa18.45■□□□□ 0.54
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PACS1-201ENST00000320580 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 STAG1Q8WVM7 1258 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 MIEF2Q96C03 454 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 AIFM3Q96NN9 605 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 CCT8L2Q96SF2 557 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 TSG101Q99816 390 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 KIF9Q9HAQ2 790 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 BTBD18B2RXH4 712 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 CEP104O60308 925 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 ATP5JP18859 108 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 FAM53CQ9NYF3 392 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 RICTORQ6R327 1708 aa18.45■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 CCDC160A6NGH7 325 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 PPP1R37O75864 691 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 POLA2Q14181 598 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 VSIG1Q86XK7 387 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 KCND1Q9NSA2 647 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 BACH1O14867 736 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 KRT12Q99456 494 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 RPS6KA5O75582 802 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 SETDB1Q15047 1291 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 MFSD6Q6ZSS7 791 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 CADPS2Q86UW7 1296 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 STIM2Q9P246 746 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 FOXN1O15353 648 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 ASIC1P78348 528 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 METTL24Q5JXM2 366 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 CCDC25Q86WR0 208 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-201ENST00000320580 HVCN1Q96D96 273 aa18.44■□□□□ 0.54
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