RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 MYH6P13533 1939 aa25.82■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 CTDNEP1O95476 244 aa25.81■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.8■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 JAK2O60674 1132 aa25.8■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 GJB2P29033 226 aa25.79■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 KIF5BP33176 963 aa25.79■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 GRM4Q14833 912 aa25.79■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.79■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.726e-7■■■■■ 32.1
CTU2-201ENST00000312060 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.79■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 CDKL5O76039 1030 aa25.78■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 NTRK3Q16288 839 aa25.78■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 PICK1Q9NRD5 415 aa25.78■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 OTOFQ9HC10 1997 aa25.78■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 A0A1W2PRG0 241 aa25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 PDHBP11177 359 aa25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 MAP3K9P80192 1104 aa25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 ACER1Q8TDN7 264 aa25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 USP17L5A8MUK1 530 aa25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 TRAF5O00463 557 aa25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 ECE1P42892 770 aa25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 DDX11Q96FC9 970 aa25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 TMX2Q9Y320 296 aa25.77■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 PPFIA3O75145 1194 aa25.76■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 IFNAR1P17181 557 aa25.76■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.76■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.76■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.75■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.75■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 F5H6K3 240 aa25.75■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 RAD21O60216 631 aa25.75■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 SNHG28P0DPA3 235 aa25.75■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 DDIT3P35638 169 aa25.75■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 KLRC3Q07444 240 aa25.75■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 RASGRP2Q7LDG7 609 aa25.75■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.75■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.75■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 SH2D4AQ9H788 454 aa25.75■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 GNAQP50148 359 aa25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 SLFN13Q68D06 897 aa25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 PHKBQ93100 1093 aa25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA8HP0CJ92 632 aa25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 PTPRAP18433 802 aa25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 CHADLQ6NUI6 762 aa25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 CSADQ9Y600 493 aa25.74■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 VGLL4Q14135 290 aa25.73■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 MAP3K11Q16584 847 aa25.73■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 ASPRV1Q53RT3 343 aa25.73■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 MOB2Q70IA6 237 aa25.73■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 NBPF11Q86T75 865 aa25.73■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.73■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 KLRF2D3W0D1 207 aa25.72■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 NDUFB10O96000 172 aa25.72■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 SLC1A4P43007 532 aa25.72■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.72■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 DCAF4Q8WV16 495 aa25.72■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 FEZ1Q99689 392 aa25.72■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.72■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 GOPCQ9HD26 462 aa25.72■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.72■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 ZNF543Q08ER8 600 aa25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 FUT2Q10981 343 aa25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 KIF3AQ9Y496 699 aa25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
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