RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
PTX4-201ENST00000293922 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 ZMYM6O95789 1325 aa21.64■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 ALX1Q15699 326 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 SBK1Q52WX2 424 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 USP17L15C9J2P7 530 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 USP17L11C9JVI0 530 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 USP17L18D6R9N7 530 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 USP17L22D6RA61 530 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 USP17L19D6RCP7 530 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 USP17L20D6RJB6 530 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 USP17L24Q0WX57 530 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 CCDC17Q96LX7 622 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 FGAP02671 866 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 HSPA4P34932 840 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 IRF5Q13568 498 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 NECTIN1Q15223 517 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 MTFR1Q15390 333 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 COA7Q96BR5 231 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.61■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 APPP05067 770 aa21.61■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 SLAIN1Q8ND83 568 aa21.61■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.61■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.61■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.61■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 ADCY3O60266 1144 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 ICA1Q05084 483 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 Q3C1V9 767 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 GJD2Q9UKL4 321 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 MCCP23508 829 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 ERVK-9P63128 1117 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 ERVK-24P63145 666 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 PXYLP1Q8TE99 480 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 KCNB2Q92953 911 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 NAPBQ9H115 298 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 MYH8P13535 1937 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 CNMDO75829 334 aa21.58■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 ELNP15502 786 aa21.58■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 TDO2P48775 406 aa21.58■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.58■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 TMX2Q9Y320 296 aa21.58■■□□□ 1.05
PTX4-201ENST00000293922 RASA1P20936 1047 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 LBX2Q6XYB7 198 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 PORCNQ9H237 461 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 SLC27A2O14975 620 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 RNF20Q5VTR2 975 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 IL17RAQ96F46 866 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 SH2D4AQ9H788 454 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 CYP21A2P08686 494 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 CCL5P13501 91 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 MAPK4P31152 587 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 ANAPC15P60006 121 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 UBXN2AP68543 259 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 LPAR1Q92633 364 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 VCPKMTQ9H867 229 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 INHAP05111 366 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 BTBD7Q9P203 1132 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 ZNF213O14771 459 aa21.54■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 RASEFQ8IZ41 740 aa21.54■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 SHISA4Q96DD7 197 aa21.54■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.54■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 RNF208Q9H0X6 261 aa21.54■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.54■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.54■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
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