RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 NPY5RQ15761 445 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 STX1AQ16623 288 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 SHC4Q6S5L8 630 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 CBX8Q9HC52 389 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 TNFRSF25Q93038 417 aa24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 SDF4Q9BRK5 362 aa24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 PPIP5K2O43314 1243 aa24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 PSMD1Q99460 953 aa24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 CABP5Q9NP86 173 aa24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 SH3GLB2Q9NR46 395 aa24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 SWAP70Q9UH65 585 aa24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 ADCY5O95622 1261 aa24.71■■□□□ 1.55
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SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF165P49910 485 aa24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 STX8Q9UNK0 236 aa24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.7■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.7■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.7■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 SYKP43405 635 aa24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 ANO10Q9NW15 660 aa24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 HLA-DOAP06340 250 aa24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNA3P22001 575 aa24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 LUZP1Q86V48 1076 aa24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 DPEP1P16444 411 aa24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 CLIC6Q96NY7 704 aa24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 EHD4Q9H223 541 aa24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 BMP15O95972 392 aa24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 CALML3P27482 149 aa24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 IDI2Q9BXS1 227 aa24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM75PA6NK02 468 aa24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 SMARCA1P28370 1054 aa24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 CLCN1P35523 988 aa24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 CEP95Q96GE4 821 aa24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 VPS33BQ9H267 617 aa24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 SIPA1L1O43166 1804 aa24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 AP5Z1O43299 807 aa24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 NLRP5P59047 1200 aa24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 IQCB1Q15051 598 aa24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 SOGA3Q5TF21 947 aa24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 YDJCA8MPS7 323 aa24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 TRAPPC10P48553 1259 aa24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 NFIAQ12857 509 aa24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM205CA6NFA0 338 aa24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25-201ENST00000293861 CYTH3O43739 400 aa24.64■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.64■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 MYH4Q9Y623 1939 aa24.64■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 TGFB2P61812 414 aa24.63■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 GALNT17Q6IS24 598 aa24.63■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.63■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 KLRF2D3W0D1 207 aa24.63■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 SHMT1P34896 483 aa24.63■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 AKR1B1P15121 316 aa24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 KRBA2Q6ZNG9 492 aa24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 BLIDQ8IZY5 108 aa24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC17Q96LX7 622 aa24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.61■■□□□ 1.53
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