RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.83■■□□□ 1.25
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CXCL16-201ENST00000293778 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.78■■□□□ 1.24
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CXCL16-201ENST00000293778 MAP7D2Q96T17 732 aa22.77■■□□□ 1.24
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CXCL16-201ENST00000293778 PTPN14Q15678 1187 aa22.76■■□□□ 1.23
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CXCL16-201ENST00000293778 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL16-201ENST00000293778 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.75■■□□□ 1.23
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CXCL16-201ENST00000293778 SLF2Q8IX21 1173 aa22.74■■□□□ 1.23
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CXCL16-201ENST00000293778 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL16-201ENST00000293778 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.74■■□□□ 1.23
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