RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 OSBP2Q969R2 916 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L12C9JPN9 530 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L21D6R901 530 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 C12orf42Q96LP6 360 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 A0A1W2PRG0 241 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 HERVK_113P62684 666 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 TMX3Q96JJ7 454 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 TTC14Q96N46 770 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 CUL4AQ13619 759 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 CTR9Q6PD62 1173 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 CABP5Q9NP86 173 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 ELNP15502 786 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 FEZ1Q99689 392 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 RLFQ13129 1914 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 M0R2C6 588 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 AKR1B1P15121 316 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 Q3C1V9 767 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 APPBP2Q92624 585 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 SLC27A2O14975 620 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 ADCY3O60266 1144 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 VCAM1P19320 739 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 CDK8P49336 464 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 SWAP70Q9UH65 585 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 GJD2Q9UKL4 321 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 IRF5Q13568 498 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 RNF20Q5VTR2 975 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 COA7Q96BR5 231 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 SHISA4Q96DD7 197 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXC6-201ENST00000243108 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 GPAA1O43292 621 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 CNMDO75829 334 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 CCL5P13501 91 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 USP14P54578 494 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 PORCNQ9H237 461 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L15C9J2P7 530 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L11C9JVI0 530 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L18D6R9N7 530 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L22D6RA61 530 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L19D6RCP7 530 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L20D6RJB6 530 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 MCM4P33991 863 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 ERVK-9P63128 1117 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 ERVK-24P63145 666 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L24Q0WX57 530 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 PARP14Q460N5 1801 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 INHAP05111 366 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 NUCB2P80303 420 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 SBK1Q52WX2 424 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 VPS53Q5VIR6 699 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC6-201ENST00000243108 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms