RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229270.8

TPI1-201, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-201ENST00000229270 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
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TPI1-201ENST00000229270 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
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TPI1-201ENST00000229270 ESR2Q92731 530 aa29.95■■■□□ 2.38
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TPI1-201ENST00000229270 SMARCE1Q969G3 411 aa29.94■■■□□ 2.38
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TPI1-201ENST00000229270 USP17L12C9JPN9 530 aa29.89■■■□□ 2.38
TPI1-201ENST00000229270 USP17L21D6R901 530 aa29.89■■■□□ 2.38
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TPI1-201ENST00000229270 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
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TPI1-201ENST00000229270 HOMER1Q86YM7 354 aa29.89■■■□□ 2.38
TPI1-201ENST00000229270 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
TPI1-201ENST00000229270 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.38
TPI1-201ENST00000229270 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.88■■■□□ 2.37
TPI1-201ENST00000229270 DPEP1P16444 411 aa29.88■■■□□ 2.37
TPI1-201ENST00000229270 TGFB2P61812 414 aa29.88■■■□□ 2.37
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