RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 BACH1O14867 736 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PRDM1O75626 825 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CMA1P23946 247 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ADD2P35612 726 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PLIN2Q99541 437 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 DEPDC5O75140 1603 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 LMAN1P49257 510 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TCHPQ9BT92 498 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MYL10Q9BUA6 226 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TSKSQ9UJT2 592 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MTMR6Q9Y217 621 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SMCO2A6NFE2 343 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ERICH4A6NGS2 130 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L12C9JPN9 530 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L21D6R901 530 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PPP6R2O75170 966 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 STAMBPO95630 424 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SCG2P13521 617 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 BTDP43251 543 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NELFBQ8WX92 580 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TNKSO95271 1327 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PPIP5K2O43314 1243 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 GYG1P46976 350 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TRAPPC10P48553 1259 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NLRP10Q86W26 655 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 KCNJ14Q9UNX9 436 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ABCC12Q96J65 1359 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 M0R2C6 588 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NDC80O14777 642 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SNX16P57768 344 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 GTF2IP78347 998 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 FAM47AQ5JRC9 791 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC122Q5T0U0 273 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ERO1AQ96HE7 468 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 FNBP1Q96RU3 617 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 VPS54Q9P1Q0 977 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1W2PQ27 194 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1W2PQ64 194 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1W2PQD8 194 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NLRX1Q86UT6 975 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 UNC5CLQ8IV45 518 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 IWS1Q96ST2 819 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CUEDC2Q9H467 287 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PALD1Q9ULE6 856 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PPLO60437 1756 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 H7C1W4 665 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 BBOX1O75936 387 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 VAV2P52735 878 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SYT10Q6XYQ8 523 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CDHR2Q9BYE9 1310 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP6O43182 974 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 IVLP07476 585 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PFKFB1P16118 471 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ASPRV1Q53RT3 343 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 BRINP3Q76B58 766 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SCRN1Q12765 414 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC17Q96LX7 622 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TNFAIP3P21580 790 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CDC25BP30305 580 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PHKA1P46020 1223 aa7.21□□□□□ -1.26
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