RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623935.1

SOX9-AS1-217, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 1,563 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CALM2P0DP24 149 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CALM3P0DP25 149 aa10□□□□□ -0.81
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SOX9-AS1-217ENST00000623935 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SIPA1L1O43166 1804 aa9.97□□□□□ -0.81
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SOX9-AS1-217ENST00000623935 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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SOX9-AS1-217ENST00000623935 RTN1Q16799 776 aa9.96□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa9.96□□□□□ -0.82
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SOX9-AS1-217ENST00000623935 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.96□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FANCBQ8NB91 859 aa9.96□□□□□ -0.82
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