RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617649.4

ACACA-240, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5 BASIC

Gene ACACA, Length 7,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-240	ENST00000617649	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	TRPC6	Q9Y210	931 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	GINS2	Q9Y248	185 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	DAPK3	O43293	454 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	SERPINB2	P05120	415 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	SYT1	P21579	422 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	GJC1	P36383	396 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	BTD	P43251	543 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	ANO1	Q5XXA6	986 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	MYCT1	Q8N699	235 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	USP26	Q9BXU7	913 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	FLOT1	O75955	427 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CTAGE8	P0CG41	777 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	KCTD2	Q14681	263 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	TXK	P42681	527 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	PLA2R1	Q13018	1463 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	GCNT3	O95395	438 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	MIS12	Q9H081	205 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	ADRA2B	P18089	450 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	TYRO3	Q06418	890 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	PPP1R7	Q15435	360 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	DPP9	Q86TI2	863 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	METTL13	Q8N6R0	699 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649		E7EVH7	732 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CNGA1	P29973	690 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CBX1	P83916	185 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC114	Q96M63	670 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	SGSM2	O43147	1006 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	FBXO11	Q86XK2	927 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CEP63	Q96MT8	703 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	ATG3	Q9NT62	314 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	PALLD	Q8WX93	1383 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	ALDH3A1	P30838	453 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	TNNC1	P63316	161 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	MYL5	Q02045	173 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	HAUS7	Q99871	368 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	ERBB3	P21860	1342 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	TUBB	P07437	444 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	GPR108	Q9NPR9	543 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	TNFAIP3	P21580	790 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	TFDP1	Q14186	410 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	DOK7	Q18PE1	504 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	INF2	Q27J81	1249 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	TTLL6	Q8N841	843 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	CDHR1	Q96JP9	859 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ACACA-240	ENST00000617649	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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