RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TOP1P11387 765 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.92□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.92□□□□□ -0.82
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIF5BP33176 963 aa9.92□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOVP48745 357 aa9.92□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TROAPQ12815 778 aa9.92□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLFN13Q68D06 897 aa9.92□□□□□ -0.82
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.92□□□□□ -0.82
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