RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 NEK9Q8TD19 979 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TAF4BQ92750 862 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 UIMC1Q96RL1 719 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 IWS1Q96ST2 819 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CORO1BQ9BR76 489 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 USP26Q9BXU7 913 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 SBF2Q86WG5 1849 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKARQ7Z5J8 1434 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 RASSF10A6NK89 507 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 EVI5O60447 810 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CAPN15O75808 1086 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 MBD4O95243 580 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 MMEP08473 750 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 MSL3P1P0C860 447 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TUBB2AQ13885 445 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 FAAH2Q6GMR7 532 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 SLF2Q8IX21 1173 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 USP33Q8TEY7 942 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC35B4Q969S0 331 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 SH3GL1Q99961 368 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGGTB-208ENST00000471759 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRD1A4D1F6 860 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 BECN2A8MW95 431 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TMCC1O94876 653 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ABL2P42684 1182 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.225e-8■■□□□ 13.8
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RABGGTB-208ENST00000471759 HDAC4P56524 1084 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
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RABGGTB-208ENST00000471759 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 PAGR1Q9BTK6 254 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 JADE2Q9NQC1 790 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 STRN4Q9NRL3 753 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ATXN10Q9UBB4 475 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
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RABGGTB-208ENST00000471759 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 STXBP3O00186 592 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGGTB-208ENST00000471759 MGRN1O60291 552 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 KDM1AO60341 852 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF40O75150 1001 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC166P0CW27 439 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 NAT2P11245 290 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 NLRP5P59047 1200 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CCZ1BP86790 482 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TYRO3Q06418 890 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 USH1GQ495M9 461 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.41□□□□□ -1.22
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