RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, human

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CB-208	ENST00000455580	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	MYH7	P12883	1935 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L15	C9J2P7	530 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L11	C9JVI0	530 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L18	D6R9N7	530 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L22	D6RA61	530 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L19	D6RCP7	530 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L20	D6RJB6	530 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L24	Q0WX57	530 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	GJD2	Q9UKL4	321 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	SMIM22	K7EJ46	135 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	ERC2	O15083	957 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	PEX10	O60683	326 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	CCL5	P13501	91 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580		Q3C1V9	767 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	CTR9	Q6PD62	1173 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	OSBP2	Q969R2	916 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580		A0A1W2PRG0	241 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	ELN	P15502	786 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	CDK8	P49336	464 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	APPBP2	Q92624	585 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	VCAM1	P19320	739 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	CCDC17	Q96LX7	622 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	RNF208	Q9H0X6	261 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	GJB1	P08034	283 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	AKR1B1	P15121	316 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	ERVK-9	P63128	1117 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	ERVK-24	P63145	666 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP1CB-208	ENST00000455580	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	GCC1	Q96CN9	775 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	INHA	P05111	366 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	MX1	P20591	662 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	GJA8	P48165	433 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	AAMP	Q13685	434 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	SBK1	Q52WX2	424 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAPK4	P31152	587 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	LBX2	Q6XYB7	198 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	SHISA4	Q96DD7	197 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	GPAA1	O43292	621 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	CNMD	O75829	334 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	PORCN	Q9H237	461 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	GNAT2	P19087	354 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580		M0R2C6	588 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMX2	Q9Y320	296 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PPP1CB-208	ENST00000455580	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	SGPL1	O95470	568 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	ICA1	Q05084	483 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	FSD1	Q9BTV5	496 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	STAP2	Q9UGK3	403 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	CYP2B6	P20813	491 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	COG2	Q14746	738 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	GPR142	Q7Z601	462 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP6NL	Q92738	828 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PPP1CB-208	ENST00000455580	SH2D4A	Q9H788	454 aa		28.75	■■■□□ 2.19

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