RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L18D6R9N7 530 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L22D6RA61 530 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L17D6RBQ6 530 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L19D6RCP7 530 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L20D6RJB6 530 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVK-9P63128 1117 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVK-24P63145 666 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABPAQ06546 454 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L24Q0WX57 530 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAUS7Q99871 368 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRCC1Q9C099 1032 aa31.66■■■□□ 2.66
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPK4P31152 587 aa31.65■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADD2P35612 726 aa31.65■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACER1Q8TDN7 264 aa31.65■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP31.65■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARMT1Q9H993 441 aa31.65■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLXNB2O15031 1838 aa31.65■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q3C1V9 767 aa31.64■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOCS4Q8WXH5 440 aa31.64■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDT12Q9BQG2 462 aa31.64■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP2B6P20813 491 aa31.63■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EVX2Q03828 476 aa31.63■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa31.63■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MBD4O95243 580 aa31.62■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VCAM1P19320 739 aa31.62■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GUCY1A2P33402 732 aa31.62■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEPT2Q15019 361 aa31.62■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POTEEQ6S8J3 1075 aa31.62■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PORCNQ9H237 461 aa31.62■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPTORQ8N122 1335 aa31.61■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP2D6P10635 497 aa31.61■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM32Q13049 653 aa31.61■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLFNL1Q499Z3 407 aa31.61■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa31.61■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIB2Q92519 343 aa31.61■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDH10Q9P2E7 1040 aa31.61■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa31.61■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa31.6■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SWAP70Q9UH65 585 aa31.6■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKAB2O43741 272 aa31.59■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR142Q7Z601 462 aa31.59■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHH3Q7Z736 793 aa31.59■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE3CQ15386 1083 aa31.58■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NR2E3Q9Y5X4 410 aa31.58■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNMDO75829 334 aa31.57■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNA1P78396 465 aa31.57■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa31.57■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC44A5Q8NCS7 719 aa31.57■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP6NLQ92738 828 aa31.57■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGS2P41220 211 aa31.56■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MORN1Q5T089 497 aa31.56■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM179Q6ZVK1 233 aa31.56■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DYNLL2Q96FJ2 89 aa31.56■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYH7P12883 1935 aa31.55■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHGBP05060 677 aa31.55■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LBX2Q6XYB7 198 aa31.55■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMOTL1Q8IY63 956 aa31.55■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKLE1Q8NAG6 615 aa31.55■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDRGK1Q96HY6 314 aa31.55■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PRG0 241 aa31.54■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa31.54■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRDL2Q6WN34 429 aa31.54■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NECAB2Q7Z6G3 386 aa31.54■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ECHDC1Q9NTX5 307 aa31.54■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYH8P13535 1937 aa31.52■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EVI5O60447 810 aa31.52■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C12orf60Q5U649 245 aa31.52■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR78Q5VTH9 848 aa31.52■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APBA2Q99767 749 aa31.52■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCTPP1Q9H773 170 aa31.52■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTBD7Q9P203 1132 aa31.52■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa31.52■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa31.51■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L12C9JPN9 530 aa31.51■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L21D6R901 530 aa31.51■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP31.51■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP2K5Q13163 448 aa31.51■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPATCH3Q96I76 525 aa31.51■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKR1B1P15121 316 aa31.5■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COG2Q14746 738 aa31.5■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL14Q16627 93 aa31.5■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC17Q96LX7 622 aa31.5■■■□□ 2.63
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