RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF521Q96K83 1311 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 ESRRGP62508 458 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 OR8K1Q8NGG5 319 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 CD248Q9HCU0 757 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 CETN1Q12798 172 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC80Q76M96 950 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 PIK3R4Q99570 1358 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 DCTN3O75935 186 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 VPS37DQ86XT2 251 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 UBL4BQ8N7F7 174 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 LRRC31Q6UY01 552 aa7.13□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.13□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.13□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 TNNQ9UQP3 1299 aa7.13□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa7.13□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 MEIS3Q99687 375 aa7.13□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 FANCLQ9NW38 375 aa7.13□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 ABCF2Q9UG63 623 aa7.13□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 CCDC93Q567U6 631 aa7.12□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 GMNNO75496 209 aa7.12□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 GPTP24298 496 aa7.12□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 LMNB2Q03252 620 aa7.12□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 CUL4BQ13620 913 aa7.12□□□□□ -1.27
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