RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 MAP7Q14244 749 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 VHLLQ6RSH7 139 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 FAM20CQ8IXL6 584 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 FAM178BQ8IXR5 827 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 MFSD2AQ8NA29 543 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 XAGE3Q8WTP9 111 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRC-205ENST00000391970 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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PTPRC-205ENST00000391970 CCDC85CA6NKD9 419 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 PDPK1O15530 556 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 DDAH1O94760 285 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 BMP3P12645 472 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 GBP1P32455 592 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 PMS1P54277 932 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-205ENST00000391970 RASGRF1Q13972 1273 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-205ENST00000391970 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 CD163Q86VB7 1156 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 JAZF1Q86VZ6 243 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM192Q8IY95 271 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJB8Q8NHS0 232 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 KLHL6Q8WZ60 621 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 DCAF5Q96JK2 942 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 SLC6A18Q96N87 628 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-205ENST00000391970 PCDHB10Q9UN67 800 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-205ENST00000391970 TLDC2A0PJX2 215 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 SLITRK5O94991 958 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 GDF11O95390 407 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 RXRBP28702 533 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 SLC7A5Q01650 507 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 KCNMA1Q12791 1236 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 BBS9Q3SYG4 887 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 LETMD1Q6P1Q0 360 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 PPFIBP1Q86W92 1011 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 DHRS1Q96LJ7 313 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 MIPEPQ99797 713 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 LGR6Q9HBX8 967 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 C1GALT1Q9NS00 363 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 CADPSQ9ULU8 1353 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 C9IYK1 514 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 DHX15O43143 795 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 CLEC3AO75596 197 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 CDK5R2Q13319 367 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 GNPTABQ3T906 1256 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 KIAA1211LQ6NV74 962 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 BEND4Q6ZU67 534 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 NLGN1Q8N2Q7 840 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 KCNF1Q9H3M0 494 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 CEP131Q9UPN4 1083 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 SUSD5O60279 629 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 ETV3P41162 512 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 NFKBIBQ15653 356 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 SDE2Q6IQ49 451 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 PAOXQ6QHF9 649 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 EEPD1Q7L9B9 569 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 CDH24Q86UP0 819 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 CLEC10AQ8IUN9 316 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 TOP6BLQ8N6T0 577 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 RIN3Q8TB24 985 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 VWCEQ96DN2 955 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJC7Q99615 494 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 FAM83CQ9BQN1 747 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 DUSP23Q9BVJ7 150 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 EOMESO95936 686 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 TP53P04637 393 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 GATA4P43694 442 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 CHMP4BP1P59074 171 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 RNF4P78317 190 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 SLC10A6Q3KNW5 377 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 MTERF2Q49AM1 385 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 SPATC1Q76KD6 591 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 RNF141Q8WVD5 230 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 GATA6Q92908 595 aa4.66□□□□□ -1.66
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