RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 PICK1Q9NRD5 415 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 RAB6AP20340 208 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ASPAP45381 313 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 MLECQ14165 292 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 SGO2Q562F6 1265 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 HID1Q8IV36 788 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLFN12Q8IYM2 578 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM169BQ8N8A8 192 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 CPLX3Q8WVH0 158 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 GATA6Q92908 595 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM87BQ96K49 555 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 TM9SF2Q99805 663 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 YIPF2Q9BWQ6 316 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 SEMA6CQ9H3T2 930 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATG3Q9NT62 314 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 TJP2Q9UDY2 1190 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 TNFRSF10CO14798 259 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 CST3P01034 146 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 YARSP54577 528 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 NKG7Q16617 165 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDCP2Q5VXM1 449 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 FBXW10Q5XX13 1052 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 CKAP2LQ8IYA6 745 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM13CQ8NE31 585 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANTXR1Q9H6X2 564 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 CNNM2Q9H8M5 875 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 KLHL3Q9UH77 587 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 KLF4O43474 513 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRIG2O94898 1065 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 NME1P15531 152 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 GUCY2CP25092 1073 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ETFBP38117 255 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 RBL2Q08999 1139 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 SERINC3Q13530 473 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC6A19Q695T7 634 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 AGBL5Q8NDL9 886 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATG4CQ96DT6 458 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 CRBNQ96SW2 442 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 MRVI1Q9Y6F6 885 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC22A31A6NKX4 558 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 PAPLNO95428 1278 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ACRP10323 421 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 USP11P51784 963 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 CASP7P55210 303 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAP7Q14244 749 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARSHQ5FYA8 562 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZAR1Q86SH2 424 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 SHISA5Q8N114 240 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 FBLIM1Q8WUP2 373 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ACTR10Q9NZ32 417 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 RAG1P15918 1043 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADMP35318 185 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCNFP41002 786 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 RAB33AQ14088 237 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 SOGA3Q5TF21 947 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 PAOXQ6QHF9 649 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 RUFY4Q6ZNE9 571 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 TTC6Q86TZ1 520 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNAJB8Q8NHS0 232 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 FOXQ1Q9C009 403 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 LNPKQ9C0E8 428 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC12A7Q9Y666 1083 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-190P-201ENST00000384154 A0A1W2PQH9 124 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-190P-201ENST00000384154 UPK3BL1B0FP48 263 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-190P-201ENST00000384154 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-190P-201ENST00000384154 UPK3BL2E5RIL1 263 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-190P-201ENST00000384154 CYP26A1O43174 497 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-190P-201ENST00000384154 NFICP08651 508 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms