RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 SNED1Q8TER0 1413 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 C21orf2O43822 256 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 ADALQ6DHV7 355 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 FSIP1Q8NA03 581 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 PNMA1Q8ND90 353 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 TEKT1Q969V4 418 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 CRKP46108 304 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 DACT2Q5SW24 774 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 OXER1Q8TDS5 423 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 SLC39A14Q15043 492 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K14Q99558 947 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 NR5A1Q13285 461 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 PTPAQ15257 358 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 KLHL34Q8N239 644 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PQ27 194 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PQ64 194 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PQD8 194 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 STX8Q9UNK0 236 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GVL5 298 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 KIF5BP33176 963 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 GRM4Q14833 912 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 MTMR7Q9Y216 660 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 MYH8P13535 1937 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 CCDC192P0DO97 292 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 XBP1P17861 261 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 DPEP1P16444 411 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 TTLL6Q8N841 843 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 PPIP5K2O43314 1243 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 NDUFA8P51970 172 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 TYRO3Q06418 890 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 GABPAQ06546 454 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 NFIAQ12857 509 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 KCNA3P22001 575 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 MRIQ9BWK5 157 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 YDJCA8MPS7 323 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 PPP6R2O75170 966 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 SCG2P13521 617 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.899e-7■■■□□ 17.1
ACTB-201ENST00000331789 CACNB3P54284 484 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 CEP95Q96GE4 821 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 FAM205CA6NFA0 338 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 KINO60870 393 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 KRT2P35908 639 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 UVSSAQ2YD98 709 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 CABP5Q9NP86 173 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 AKR1B1P15121 316 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 CMA1P23946 247 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 ATP2B1P20020 1258 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 NPY5RQ15761 445 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 CLIC6Q96NY7 704 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-201ENST00000331789 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.9 ms