RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ATP2B2Q01814 1243 aa20.45■□□□□ 0.86
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SPCS1-201ENST00000233025 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.45■□□□□ 0.86
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SPCS1-201ENST00000233025 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.41■□□□□ 0.86
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SPCS1-201ENST00000233025 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
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SPCS1-201ENST00000233025 SIL1Q9H173 461 aa20.36■□□□□ 0.85
SPCS1-201ENST00000233025 USP17L15C9J2P7 530 aa20.35■□□□□ 0.85
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SPCS1-201ENST00000233025 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.34■□□□□ 0.85
SPCS1-201ENST00000233025 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SPCS1-201ENST00000233025 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SPCS1-201ENST00000233025 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.34■□□□□ 0.85
SPCS1-201ENST00000233025 PARP14Q460N5 1801 aa20.34■□□□□ 0.85
SPCS1-201ENST00000233025 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SPCS1-201ENST00000233025 KCNQ1P51787 676 aa20.33■□□□□ 0.85
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM240Q5SV17 173 aa20.33■□□□□ 0.85
SPCS1-201ENST00000233025 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.33■□□□□ 0.85
SPCS1-201ENST00000233025 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.33■□□□□ 0.85
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.33■□□□□ 0.85
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