RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 WTAPQ15007 396 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 IQCA1Q86XH1 822 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 CDCA5Q96FF9 252 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 STX8Q9UNK0 236 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.81■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.81■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 ATP2B2Q01814 1243 aa21.81■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 ST3GAL1Q11201 340 aa21.81■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.81■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.81■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.81■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.81■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 MAP3K10Q02779 954 aa21.8■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM87BQ96K49 555 aa21.8■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.8■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D12O60347 775 aa21.8■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.79■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.79■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.79■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 ERICH2A1L162 156 aa21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 CAP2P40123 477 aa21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 WRNIP1Q96S55 665 aa21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 MICU3Q86XE3 530 aa21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.78■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.77■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 APOA5Q6Q788 366 aa21.77■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.77■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC69A6NI79 296 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 LDHDQ86WU2 507 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC17Q96LX7 622 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 MYH4Q9Y623 1939 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 LIFRP42702 1097 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 ECE1P42892 770 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 SCRN1Q12765 414 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD1Q15327 319 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 ACER1Q8TDN7 264 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 KLRG1Q96E93 195 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 A0A1W2PRG0 241 aa21.75■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 RAD21O60216 631 aa21.75■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.75■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.75■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 FBXL16Q8N461 479 aa21.75■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 CABP5Q9NP86 173 aa21.75■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.75■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 CDC27P30260 824 aa21.74■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 DGKZQ13574 1117 aa21.74■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 DCAF15Q66K64 600 aa21.74■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.74■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 ICA1Q05084 483 aa21.74■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.74■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.74■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.74■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 KIF3CO14782 793 aa21.73■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 DGKHQ86XP1 1220 aa21.73■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.73■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 PNMA1Q8ND90 353 aa21.73■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.73■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 KAT14Q9H8E8 782 aa21.73■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.73■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.72■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB43O43298 467 aa21.72■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 MCM2P49736 904 aa21.72■■□□□ 1.07
PRRT1-201ENST00000211413 MRE11P49959 708 aa21.72■■□□□ 1.07
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