RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060125.6

Scn4b-201, Transcript of Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4b, Length 4,982 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cnga4Q3UW12 575 aa15.37■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Naa30Q8CES0 364 aa15.37■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Abhd8Q8R0P8 439 aa15.37■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 SufuQ9Z0P7 484 aa15.37■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Eef1bO70251 225 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nr1d1Q3UV55 615 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Actr5Q80US4 605 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fam114a2Q8VE88 497 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Smc6Q924W5 1097 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cwc25Q9DBF7 416 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 E330017A01RikQ8BU47 192 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pdlim2Q8R1G6 349 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 RpainQ9CWY9 219 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sf3a3Q9D554 501 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Prr16A3KMN5 304 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Abcb4P21440 1276 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 PpardP35396 440 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gnat2P50149 354 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cplx3Q8R1B5 158 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 P4ha1Q60715 534 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dnm3Q8BZ98 863 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Paip2bQ91W45 136 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Actn2Q9JI91 894 aa15.36■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tecpr2Q3UH45 1423 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Spata31d1bE9QA57 1361 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zfp651E9PZ11 729 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Klhl34A2AI76 644 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Vwa3bJ9JI28 736 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Stx12Q9ER00 274 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Capn12Q9ER56 720 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Casp8O89110 480 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 PparaP23204 468 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Vil1Q62468 827 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 GopcQ8BH60 463 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem60Q8K174 133 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 KynuQ9CXF0 464 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hecw2Q6I6G8 1578 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trim7Q923T7 510 aa15.35■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Erich2E9Q1A6 463 aa15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gna11P21278 359 aa15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 NelfbQ8C4Y3 580 aa15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc182Q9D9C6 152 aa15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Bpifb4A2BGH0 617 aa15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Eif2b5Q8CHW4 717 aa15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rapgef3Q8VCC8 918 aa15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Plekho1Q9JIY0 408 aa15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Akr1c19G3X9Y6 323 aa15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Spg7Q3ULF4 781 aa15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tpcn2Q8BWC0 731 aa15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ero1aQ8R180 464 aa15.34■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 EsrrgP62509 458 aa15.33■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pfkfb1P70266 471 aa15.33■□□□□ 0.05
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Stk36Q69ZM6 1316 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc92bQ5SUE3 299 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Serpinb13Q8CDC0 389 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mylk2Q8VCR8 613 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mrps22Q9CXW2 359 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Myo5cE9Q1F5 1742 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Apol7bB1AQP7 369 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tm6sf1P58749 370 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Q3TYL0 343 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Map3k7Q62073 579 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc80Q8R2G6 949 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Speer4f2E9Q366 295 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc4a4O88343 1079 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dcaf17Q3TUL7 519 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm136Q3V037 328 aa15.33■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nsd3Q6P2L6 1439 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Adamts13Q769J6 1426 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Skor2A7M7C7 1008 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Taf4E9QAP7 1042 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc129Q14B48 1034 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dzip1Q8BMD2 852 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ttc5Q99LG4 440 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Spc24Q9D083 201 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cnbd1B1AWM0 430 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Arhgap42B2RQE8 841 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Usp5P56399 858 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Smarcad1Q04692 1021 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Srek1ip1Q4V9W2 153 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Asxl2Q8BZ32 1370 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rabep2Q91WG2 554 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Msantd4Q91YU3 345 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cyth1Q9QX11 398 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Snx1Q9WV80 522 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Robo2Q7TPD3 1470 aa15.32■□□□□ 0.04
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ppp1r12bQ8BG95 976 aa15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.3 ms