RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 CEP83Q9Y592 693 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 USP17L10C9JJH3 530 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 H7C1W4 665 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 KPNA6O60684 536 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 ERLIN2O94905 339 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 DEXIO95424 95 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 CCND2P30279 289 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 PLCD1P51178 756 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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SMAD4-212ENST00000591126 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.14□□□□□ -1.27
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SMAD4-212ENST00000591126 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 SUCLG2Q96I99 432 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 AMNQ9BXJ7 453 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 TAF5LO75529 589 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 CEP85Q6P2H3 762 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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SMAD4-212ENST00000591126 PDE1AP54750 535 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 HOOK3Q86VS8 718 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 GLG1Q92896 1179 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 CD209Q9NNX6 404 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 UNCXA6NJT0 531 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 MSCO60682 206 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 CAVIN2O95810 425 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 BEND3Q5T5X7 828 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 MTA3Q9BTC8 594 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 CCPG1Q9ULG6 757 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 FCER1AP12319 257 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 FSTL1Q12841 308 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 ISCA1Q9BUE6 129 aa7.13□□□□□ -1.27
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SMAD4-212ENST00000591126 FAM50BQ9Y247 325 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 C3P01024 1663 aa7.13□□□□□ -1.27
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SMAD4-212ENST00000591126 MICU3Q86XE3 530 aa7.13□□□□□ -1.27
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SMAD4-212ENST00000591126 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.13□□□□□ -1.27
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SMAD4-212ENST00000591126 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 SDSP20132 328 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 KCNJ6P48051 423 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 BRAPQ7Z569 592 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 PLVAPQ9BX97 442 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 TRIM75PA6NK02 468 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 BMP3P12645 472 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 RGS2P41220 211 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 SCNN1DP51172 638 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 CPXCR1Q8N123 301 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 KIFC2Q96AC6 838 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 GREM2Q9H772 168 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 DPP7Q9UHL4 492 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 USP25Q9UHP3 1055 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 GPAA1O43292 621 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 MAPK4P31152 587 aa7.12□□□□□ -1.27
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SMAD4-212ENST00000591126 AKNAD1Q5T1N1 836 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 NBPF15Q8N660 670 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 TBC1D5Q92609 795 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 DEF6Q9H4E7 631 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 ATP8B3O60423 1300 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 STAT2P52630 851 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 TFAP4Q01664 338 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 NUCB1Q02818 461 aa7.12□□□□□ -1.27
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