RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 TTC28Q96AY4 2481 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 GNAI3P08754 354 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 ITPRIPQ8IWB1 547 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 PAGR1Q9BTK6 254 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 MYH2Q9UKX2 1941 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 LTBP2Q14767 1821 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 MAST2Q6P0Q8 1798 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 EYA2O00167 538 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 EPHB4P54760 987 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 RHBDL3P58872 404 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 GRIN2CQ14957 1233 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 MORN1Q5T089 497 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 GPR142Q7Z601 462 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 TRPV1Q8NER1 839 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 PPM1EQ8WY54 764 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 ABCF2Q9UG63 623 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 TMEM265A0A087WTH1 108 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 TNFRSF10AO00220 468 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 ITGB8P26012 769 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 HERVK_113P62684 666 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 MVPQ14764 893 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 HDAC5Q9UQL6 1122 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-231ENST00000552222 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 CNGA1P29973 690 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 CAP2P40123 477 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 ATP2B3Q16720 1220 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 SH3D19Q5HYK7 790 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 COG6Q9Y2V7 657 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 FRMPD3Q5JV73 1810 aa17■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 TRIM43BA6NCK2 446 aa17■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 USP17L5A8MUK1 530 aa17■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 CYP2C19P33261 490 aa17■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 RASGRF1Q13972 1273 aa17■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 TRIM60Q495X7 471 aa17■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 DDX19BQ9UMR2 479 aa17■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 SALL1Q9NSC2 1324 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 ATAD5Q96QE3 1844 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 CNMDO75829 334 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 ERVK-9P63128 1117 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 ERVK-24P63145 666 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 MECOMQ03112 1051 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 PI16Q6UXB8 463 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 NPLOC4Q8TAT6 608 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 SOCS4Q8WXH5 440 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 TBC1D12O60347 775 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 GDF11O95390 407 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 GNAI2P04899 355 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 RGS2P41220 211 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 TIMM10P62072 90 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 CCDC102BQ68D86 513 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 FERMT2Q96AC1 680 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 APBA2Q99767 749 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 DENND2AQ9ULE3 1009 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 WDR78Q5VTH9 848 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 DNAJC18Q9H819 358 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.96■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 MAPK4P31152 587 aa16.96■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 PLA2G5P39877 138 aa16.96■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 BACE1P56817 501 aa16.96■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 MAP2K5Q13163 448 aa16.96■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 PDLIM7Q9NR12 457 aa16.96■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 EMILIN3Q9NT22 766 aa16.96■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.96■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CS-231ENST00000552222 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CS-231ENST00000552222 MTX1Q13505 466 aa16.95■□□□□ 0.3
CS-231ENST00000552222 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa16.95■□□□□ 0.3
CS-231ENST00000552222 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CS-231ENST00000552222 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CS-231ENST00000552222 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.95■□□□□ 0.3
CS-231ENST00000552222 SIPA1L1O43166 1804 aa16.94■□□□□ 0.3
CS-231ENST00000552222 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CS-231ENST00000552222 LPAR1Q92633 364 aa16.94■□□□□ 0.3
CS-231ENST00000552222 CEP126Q9P2H0 1117 aa16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms