RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 EPS15P42566 896 aa8.94□□□□□ -0.98
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USP4-211ENST00000485450 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.94□□□□□ -0.98
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USP4-211ENST00000485450 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.94□□□□□ -0.98
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USP4-211ENST00000485450 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.93□□□□□ -0.98
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USP4-211ENST00000485450 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
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USP4-211ENST00000485450 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
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USP4-211ENST00000485450 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.93□□□□□ -0.98
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USP4-211ENST00000485450 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
USP4-211ENST00000485450 GABPAQ06546 454 aa8.92□□□□□ -0.98
USP4-211ENST00000485450 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.92□□□□□ -0.98
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USP4-211ENST00000485450 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.92□□□□□ -0.98
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USP4-211ENST00000485450 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.92□□□□□ -0.98
USP4-211ENST00000485450 KLHL33A6NCF5 533 aa8.92□□□□□ -0.98
USP4-211ENST00000485450 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
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USP4-211ENST00000485450 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
USP4-211ENST00000485450 H7C1D1 291 aa8.89□□□□□ -0.99
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USP4-211ENST00000485450 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
USP4-211ENST00000485450 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
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