RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 NR1I2O75469 434 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CALM1P0DP23 149 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CALM2P0DP24 149 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CALM3P0DP25 149 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 EEF2P13639 858 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ATP5JP18859 108 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TUBB2AQ13885 445 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TUBB2BQ9BVA1 445 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TACC3Q9Y6A5 838 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 FAM13AO94988 1023 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TSPY3P0CV98 308 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TSPY8P0CW00 308 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TAF12Q16514 161 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 KRT79Q5XKE5 535 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 NCAPGQ9BPX3 1015 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 NRBP1Q9UHY1 535 aa9.89□□□□□ -0.83
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PTPRM-202ENST00000400053 MADDQ8WXG6 1647 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 KCNQ3O43525 872 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 STAMQ92783 540 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 USP6P35125 1406 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ERCC3P19447 782 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 RPL13P26373 211 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ME3Q16798 604 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MLKLQ8NB16 471 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 B4E1Z4 1266 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 LIG3P49916 1009 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PPP1R7Q15435 360 aa9.88□□□□□ -0.83
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PTPRM-202ENST00000400053 VPS52Q8N1B4 723 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TRAF5O00463 557 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 GIPC1O14908 333 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP25P42331 645 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SH2D4BQ5SQS7 431 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 KDRP35968 1356 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SLC8A3P57103 927 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PPFIA1Q13136 1202 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 APPBP2Q92624 585 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 NUF2Q9BZD4 464 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 VCXQ9H320 206 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TNNI2P48788 182 aa9.87□□□□□ -0.83
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PTPRM-202ENST00000400053 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TTC6Q86TZ1 520 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC8AQ8IWT6 810 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC26Q8TAB7 109 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CLGNO14967 610 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MAGEA1P43355 309 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 VWA3BQ502W6 1294 aa9.87□□□□□ -0.83
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PTPRM-202ENST00000400053 IFT20Q8IY31 132 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CEP120Q8N960 986 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 FAM89AQ96GI7 184 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 BCAP29Q9UHQ4 241 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 NEDD9Q14511 834 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CERS3Q8IU89 383 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PFDN4Q9NQP4 134 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MTMR6Q9Y217 621 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 BRD3Q15059 726 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 FYB2Q5VWT5 728 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 E7EVH7 732 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 RGS12O14924 1447 aa9.86□□□□□ -0.83
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