RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.44■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKS1AQ92625 1134 aa25.44■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEKT1Q969V4 418 aa25.44■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.44■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 F8W031 263 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNA3P22001 575 aa25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRAPQ7Z569 592 aa25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DGKHQ86XP1 1220 aa25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L3A6NCW0 530 aa25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L4A6NCW7 530 aa25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C21orf2O43822 256 aa25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TFAP4Q01664 338 aa25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AOC3Q16853 763 aa25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC93Q567U6 631 aa25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RCSD1Q6JBY9 416 aa25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.41■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMD1Q99460 953 aa25.41■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NMT2O60551 498 aa25.41■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.41■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AIFM3Q96NN9 605 aa25.41■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DEXIO95424 95 aa25.4■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPEP1P16444 411 aa25.4■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASA1P20936 1047 aa25.4■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.4■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRKP46108 304 aa25.39■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCNN1DP51172 638 aa25.39■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT40Q6A162 431 aa25.39■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL17RBQ9NRM6 502 aa25.39■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.39■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RCOR1Q9UKL0 485 aa25.39■■□□□ 1.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYH8P13535 1937 aa25.39■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPY3P0CV98 308 aa25.39■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPY8P0CW00 308 aa25.39■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK8P49336 464 aa25.39■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FUT2Q10981 343 aa25.39■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM29Q14134 588 aa25.39■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.39■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP3K14Q99558 947 aa25.39■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP40Q9NVE5 1235 aa25.39■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPIP5K2O43314 1243 aa25.38■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRE11P49959 708 aa25.38■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.38■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLHL34Q8N239 644 aa25.38■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TGFB2P61812 414 aa25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP28Q96RU2 1077 aa25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VPS33BQ9H267 617 aa25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTFR1LQ9H019 292 aa25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF28PB7ZC32 967 aa25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GUCY1A2P33402 732 aa25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GABPAQ06546 454 aa25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOGA3Q5TF21 947 aa25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KAT14Q9H8E8 782 aa25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLIN4Q96Q06 1357 aa25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYCE3A1L190 88 aa25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YDJCA8MPS7 323 aa25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PICALMQ13492 652 aa25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PGBD1Q96JS3 809 aa25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.33■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB7AO95365 584 aa25.33■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF5BP33176 963 aa25.33■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms