RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 DDAH1O94760 285 aa24.94■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 USP17L8P0C7I0 530 aa24.94■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 EVX2Q03828 476 aa24.94■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.94■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.94■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 NR1I2O75469 434 aa24.94■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.94■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 CNKSR1Q969H4 720 aa24.94■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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SNRNP25-201ENST00000293861 RNF214Q8ND24 703 aa24.93■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.93■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 TNMDQ9H2S6 317 aa24.93■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 ADALQ6DHV7 355 aa24.92■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 CLIC4Q9Y696 253 aa24.92■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A1W2PQ27 194 aa24.92■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A1W2PQ64 194 aa24.92■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A1W2PQD8 194 aa24.92■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC192P0DO97 292 aa24.92■■□□□ 1.58
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SNRNP25-201ENST00000293861 TEX11Q8IYF3 940 aa24.92■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 ME1P48163 572 aa24.91■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 STK38Q15208 465 aa24.91■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.91■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 GUCY1A2P33402 732 aa24.9■■□□□ 1.58
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SNRNP25-201ENST00000293861 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
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SNRNP25-201ENST00000293861 TSPY2A6NKD2 308 aa24.9■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 G3V3G9 751 aa24.9■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 MMP1P03956 469 aa24.9■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 FUT2Q10981 343 aa24.9■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.9■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 PODNQ7Z5L7 613 aa24.9■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 ENGASEQ8NFI3 743 aa24.9■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.89■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 SPTLC2O15270 562 aa24.89■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.89■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.89■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.89■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.89■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKS1AQ92625 1134 aa24.89■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.89■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 CTAGE5O15320 804 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 CAMK4Q16566 473 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 DOK7Q18PE1 504 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC39A14Q15043 492 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 DGKHQ86XP1 1220 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 FBXW7Q969H0 707 aa24.88■■□□□ 1.57
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SNRNP25-201ENST00000293861 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 FLT1P17948 1338 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 CHRNA5P30532 468 aa24.87■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.87■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 CERS5Q8N5B7 392 aa24.87■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.87■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.86■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP3K14Q99558 947 aa24.86■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.86■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 NMT2O60551 498 aa24.86■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 TYRO3Q06418 890 aa24.86■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.86■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 FSIP1Q8NA03 581 aa24.86■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.86■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.86■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP6R2O75170 966 aa24.85■■□□□ 1.57
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SNRNP25-201ENST00000293861 TFAP4Q01664 338 aa24.85■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.85■■□□□ 1.57
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SNRNP25-201ENST00000293861 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.85■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
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SNRNP25-201ENST00000293861 PTPAQ15257 358 aa24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 PKN1Q16512 942 aa24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 SNED1Q8TER0 1413 aa24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 XBP1P17861 261 aa24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.84■■□□□ 1.57
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