RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 PFKFB1P16118 471 aa21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 IL25Q9H293 177 aa21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 BLZF1Q9H2G9 400 aa21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 H0YIN7 160 aa21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 TSPYL1Q9H0U9 437 aa21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 SLC1A4P43007 532 aa21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 RASGRF1Q13972 1273 aa21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 CTAGE8P0CG41 777 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 TTC38Q5R3I4 469 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 FANCBQ8NB91 859 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 H7C1W4 665 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 SPAG1Q07617 926 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 MTX1Q13505 466 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 PTPN21Q16825 1174 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 LCORLQ8N3X6 602 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.053e-6■□□□□ 11.3
ANKRD40-201ENST00000285243 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 CRB1P82279 1406 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 USP40Q9NVE5 1235 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 CPS1P31327 1500 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 CUTAO60888 179 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 PNOCQ13519 176 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 DYMQ7RTS9 669 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 RESTQ13127 1097 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 STK32BQ9NY57 414 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 MCAMP43121 646 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 TAX1BP1Q86VP1 789 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 CLIC4Q9Y696 253 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 CTAGE9A4FU28 777 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 UBXN1Q04323 297 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 MCM3P25205 808 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 RMND1Q9NWS8 449 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 PNMA1Q8ND90 353 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 ARHGAP6O43182 974 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 PPIP5K2O43314 1243 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 COBLO75128 1261 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 GOLGA6L10A6NI86 522 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 SCARF1Q14162 830 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 APOA5Q6Q788 366 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 PAF1Q8N7H5 531 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 CEP112Q8N8E3 955 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40-201ENST00000285243 CDC25AP30304 524 aa21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 PAFAH1B1P43034 410 aa21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 ERMNQ8TAM6 284 aa21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.58■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 KIAA0754O94854 1291 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 PGBD1Q96JS3 809 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 GUCA1BQ9UMX6 200 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 CMA1P23946 247 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 ETF1P62495 437 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 MLKLQ8NB16 471 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 BICD1Q96G01 975 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 CFBP00751 764 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 SERPINB2P05120 415 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD40-201ENST00000285243 NR5A1Q13285 461 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms