RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262225.7

TMED2-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED2, Length 2,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED2-201ENST00000262225 RGS22Q8NE09 1264 aa26.91■■□□□ 1.9
TMED2-201ENST00000262225 CLSTN2Q9H4D0 955 aa26.91■■□□□ 1.9
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TMED2-201ENST00000262225 CHRNA5P30532 468 aa26.9■■□□□ 1.9
TMED2-201ENST00000262225 CCDC173Q0VFZ6 552 aa26.9■■□□□ 1.9
TMED2-201ENST00000262225 WASF1Q92558 559 aa26.9■■□□□ 1.9
TMED2-201ENST00000262225 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
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TMED2-201ENST00000262225 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
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TMED2-201ENST00000262225 IL17RBQ9NRM6 502 aa26.9■■□□□ 1.9
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TMED2-201ENST00000262225 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.89■■□□□ 1.9
TMED2-201ENST00000262225 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.95e-8■■□□□ 12.4
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TMED2-201ENST00000262225 ANO1Q5XXA6 986 aa26.89■■□□□ 1.9
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TMED2-201ENST00000262225 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
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TMED2-201ENST00000262225 H0YIN7 160 aa26.88■■□□□ 1.89
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TMED2-201ENST00000262225 USP17L4A6NCW7 530 aa26.87■■□□□ 1.89
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TMED2-201ENST00000262225 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.87■■□□□ 1.89
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TMED2-201ENST00000262225 ADALQ6DHV7 355 aa26.86■■□□□ 1.89
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TMED2-201ENST00000262225 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
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TMED2-201ENST00000262225 G3V3G9 751 aa26.86■■□□□ 1.89
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TMED2-201ENST00000262225 ENGASEQ8NFI3 743 aa26.86■■□□□ 1.89
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TMED2-201ENST00000262225 A0A1B0GVL5 298 aa26.85■■□□□ 1.89
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TMED2-201ENST00000262225 PLCG2P16885 1265 aa26.84■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 SCNN1DP51172 638 aa26.84■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa26.84■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.84■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 OXER1Q8TDS5 423 aa26.84■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 NR5A1Q13285 461 aa26.84■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 CERS3Q8IU89 383 aa26.84■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.84■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 TSPY3P0CV98 308 aa26.83■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 TSPY8P0CW00 308 aa26.83■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 RASA1P20936 1047 aa26.83■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 TYRO3Q06418 890 aa26.83■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 SLC39A14Q15043 492 aa26.83■■□□□ 1.89
TMED2-201ENST00000262225 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.83■■□□□ 1.89
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TMED2-201ENST00000262225 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
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TMED2-201ENST00000262225 CDK8P49336 464 aa26.82■■□□□ 1.88
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TMED2-201ENST00000262225 STYK1Q6J9G0 422 aa26.82■■□□□ 1.88
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TMED2-201ENST00000262225 PDLIM2Q96JY6 352 aa26.82■■□□□ 1.88
TMED2-201ENST00000262225 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.82■■□□□ 1.88
TMED2-201ENST00000262225 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.82■■□□□ 1.88
TMED2-201ENST00000262225 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.82■■□□□ 1.88
TMED2-201ENST00000262225 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.82■■□□□ 1.88
TMED2-201ENST00000262225 KAT14Q9H8E8 782 aa26.82■■□□□ 1.88
TMED2-201ENST00000262225 NDUFA8P51970 172 aa26.81■■□□□ 1.88
TMED2-201ENST00000262225 PTPAQ15257 358 aa26.81■■□□□ 1.88
TMED2-201ENST00000262225 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
TMED2-201ENST00000262225 DGKHQ86XP1 1220 aa26.81■■□□□ 1.88
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