RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217195.12

C20orf27-201, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C20orf27, Length 1,302 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-201ENST00000217195 ZNF333Q96JL9 665 aa23.67■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 TRIM47Q96LD4 638 aa23.67■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.67■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.67■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 SIPA1L1O43166 1804 aa23.66■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 CAP1Q01518 475 aa23.66■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 AAMPQ13685 434 aa23.66■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.66■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.66■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 RAET1EQ8TD07 263 aa23.66■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 CABP5Q9NP86 173 aa23.66■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.66■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.65■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 MTMR2Q13614 643 aa23.65■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 TREML2Q5T2D2 321 aa23.65■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.65■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 CENPFP49454 3210 aa23.65■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 MYPNQ86TC9 1320 aa23.65■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 MYH1P12882 1939 aa23.65■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 GDF11O95390 407 aa23.64■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
C20orf27-201ENST00000217195 USP14P54578 494 aa23.63■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 SWAP70Q9UH65 585 aa23.63■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 GH2P01242 217 aa23.62■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.62■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.62■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 ERC2O15083 957 aa23.61■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.61■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 LCORLQ8N3X6 602 aa23.61■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.61■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.61■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 COA7Q96BR5 231 aa23.61■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.61■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 MBD4O95243 580 aa23.6■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 GRK4P32298 578 aa23.6■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 PLCD1P51178 756 aa23.6■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 GABPAQ06546 454 aa23.6■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 FEZ1Q99689 392 aa23.6■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 ARMT1Q9H993 441 aa23.6■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 CTGFP29279 349 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 UBXN2AP68543 259 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 C12orf42Q96LP6 360 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 NAV1Q8NEY1 1877 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 CAPN2P17655 700 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 SHMT1P34896 483 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 JAG1P78504 1218 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 PRKCZQ05513 592 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 IRF5Q13568 498 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-201ENST00000217195 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.58■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.58■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.58■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 POTEFA5A3E0 1075 aa23.57■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 GCC1Q96CN9 775 aa23.57■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 HERVK_113P62684 666 aa23.56■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.56■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.56■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 CCDC17Q96LX7 622 aa23.56■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.56■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.56■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 USP17L15C9J2P7 530 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 USP17L11C9JVI0 530 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 USP17L18D6R9N7 530 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 USP17L22D6RA61 530 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 USP17L19D6RCP7 530 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 USP17L20D6RJB6 530 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 GNAT2P19087 354 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 FLT3LGP49771 235 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 USP17L24Q0WX57 530 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 APPBP2Q92624 585 aa23.55■■□□□ 1.36
C20orf27-201ENST00000217195 SH2D4AQ9H788 454 aa23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms