RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 POTEB2H3BUK9 544 aa7.17□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 FAM182BQ5T319 152 aa7.17□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 LDHDQ86WU2 507 aa7.17□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 ABI1Q8IZP0 508 aa7.17□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 DPEP1P16444 411 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 EPHX2P34913 555 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 ME1P48163 572 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 HUNKP57058 714 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 STRN3Q13033 797 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 ATL3Q6DD88 541 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 SLC25A27O95847 323 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 FBLN1P23142 703 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 NSMFQ6X4W1 530 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 HOMER1Q86YM7 354 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 GPC2Q8N158 579 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 DCTPP1Q9H773 170 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 USP17L15C9J2P7 530 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 USP17L11C9JVI0 530 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 USP17L18D6R9N7 530 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 USP17L22D6RA61 530 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 USP17L19D6RCP7 530 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 USP17L20D6RJB6 530 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 P4HA1P13674 534 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 USP17L24Q0WX57 530 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 E2F5Q15329 346 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 CHADLQ6NUI6 762 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 GOLGA1Q92805 767 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 STX10O60499 249 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 ADCY7P51828 1080 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 PDE4CQ08493 712 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 NOGQ13253 232 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 TRIM47Q96LD4 638 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 DBNDD1Q9H9R9 158 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 PPP2R5AQ15172 486 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 MEIS3Q99687 375 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 KATNAL1Q9BW62 490 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.261e-6■□□□□ 10.8
SMAD4-212ENST00000591126 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 TCP10Q12799 353 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 FEM1BQ9UK73 627 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD4-212ENST00000591126 PHACTR2O75167 634 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 SASH1O94885 1247 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 TTLL1O95922 423 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 KRT2P35908 639 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 LPAR1Q92633 364 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 DPF2Q92785 391 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 FAM167AQ96KS9 214 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 DDAH1O94760 285 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 CELF2O95319 508 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 CRKP46108 304 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 SUSD4Q5VX71 490 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 SAMD3Q8N6K7 520 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 FAM13AO94988 1023 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 PDE4AP27815 886 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 APLP1P51693 650 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 TTC22Q5TAA0 569 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC102BQ68D86 513 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 FBXO11Q86XK2 927 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 MICALL2Q8IY33 904 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 DCAF4Q8WV16 495 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 TTC14Q96N46 770 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-212ENST00000591126 PSMD1Q99460 953 aa7.14□□□□□ -1.27
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