RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 JAK2O60674 1132 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 WTAPQ15007 396 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 SENP2Q9HC62 589 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 SCNN1DP51172 638 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 EVX2Q03828 476 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 COL4A5P29400 1685 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPDC1A2A3K4 754 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 USP40Q9NVE5 1235 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF3AQ9Y496 699 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 MYH1P12882 1939 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC69A6NI79 296 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB43O43298 467 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 NFXL1Q6ZNB6 911 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 IQCA1Q86XH1 822 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 RGS22Q8NE09 1264 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC12A7Q9Y666 1083 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 NPM3O75607 178 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 F13A1P00488 732 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.867e-11■□□□□ 8.6
CAPNS1-207ENST00000589146 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 GMLQ99445 158 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 TNKSO95271 1327 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 PRDM1O75626 825 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 PLCD1P51178 756 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 NIM1KQ8IY84 436 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKS1AQ92625 1134 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP2R5BQ15173 497 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 IDI2Q9BXS1 227 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 DTNBO60941 627 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CDKL5O76039 1030 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC6Q86TZ1 520 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF654Q8IZM8 581 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX11Q96FC9 970 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 NFKBIEO00221 500 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMD14O00487 310 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CPLX1O14810 134 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 RASA1P20936 1047 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CDK8P49336 464 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 NTRK3Q16288 839 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPY2A6NKD2 308 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC27P30260 824 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 GABPAQ06546 454 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 MICU3Q86XE3 530 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 SPON1Q9HCB6 807 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 DDAH1O94760 285 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CALM1P0DP23 149 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CALM2P0DP24 149 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CALM3P0DP25 149 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 TFAP4Q01664 338 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 DGKHQ86XP1 1220 aa26.6■■□□□ 1.85
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