RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 RAI14Q9P0K7 980 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 VCANP13611 3396 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 GAKO14976 1311 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 HIP1O00291 1037 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 DLGAP5Q15398 846 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PACS1-208ENST00000529677 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 CDC45O75419 566 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 SPDYE6P0CI01 402 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 CHMLP26374 656 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 GSTO1P78417 241 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 CCL15Q16663 113 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 RASA3Q14644 834 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 SLF2Q8IX21 1173 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 APPBP2Q92624 585 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 TEPSINQ96N21 525 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 CHGBP05060 677 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 LDHCP07864 332 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 CFAP100Q494V2 611 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 A0A1W2PPC1 479 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 TLR2O60603 784 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 CYP7A1P22680 504 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 GJA8P48165 433 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 VGLL4Q14135 290 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 VEZTQ9HBM0 779 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 RAD50Q92878 1312 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 A0A0D9SFI3 127 aa20.22■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 OSBP2Q969R2 916 aa20.22■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 TEKT1Q969V4 418 aa20.22■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.22■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.22■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.21■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 F8W031 263 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 CRKP46108 304 aa20.21■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 PPP4CP60510 307 aa20.21■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 ARHGEF6Q15052 776 aa20.21■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.21■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 FAM227BQ96M60 508 aa20.21■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PACS1-208ENST00000529677 GJB1P08034 283 aa20.2■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 Q7L0L9 218 aa20.2■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 CERS3Q8IU89 383 aa20.2■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 TRIM47Q96LD4 638 aa20.2■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 FOCADQ5VW36 1801 aa20.2■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.2■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 BTBD19C9JJ37 291 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 SGSM2O43147 1006 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 CCL5P13501 91 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 GTF2A2P52657 109 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 M0R2C6 588 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 C8orf34Q49A92 452 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 CASC1Q6TDU7 716 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 C17orf99Q6UX52 265 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 IL25Q9H293 177 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 SRRDQ9UH36 339 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 EYSQ5T1H1 3165 aa20.17■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 OSBPP22059 807 aa20.17■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 BTDP43251 543 aa20.17■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 PRMT2P55345 433 aa20.17■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 RHBDL3P58872 404 aa20.17■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.17■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.17■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.17■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 MGAMO43451 1857 aa20.16■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.16■□□□□ 0.82
PACS1-208ENST00000529677 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.16■□□□□ 0.82
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