RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514514.5

PAIP1-208, Transcript of poly(A) binding protein interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PAIP1, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1-208ENST00000514514 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.32■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 NFIAQ12857 509 aa28.32■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 DYNLL2Q96FJ2 89 aa28.32■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.31■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 NPM3O75607 178 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 SPDYE6P0CI01 402 aa28.31■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 LMNB1P20700 586 aa28.31■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 EIF6P56537 245 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 PFKFB2O60825 505 aa28.3■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 NT5C2P49902 561 aa28.3■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 TMEM67Q5HYA8 995 aa28.3■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.3■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 GTF3C6Q969F1 213 aa28.3■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 LY9Q9HBG7 655 aa28.3■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.123e-6■□□□□ 8.1
PAIP1-208ENST00000514514 STK3Q13188 491 aa28.29■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 DLGAP5Q15398 846 aa28.29■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.29■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 LIFRP42702 1097 aa28.29■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 CACNB3P54284 484 aa28.29■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 SART3Q15020 963 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 C16orf86Q6ZW13 317 aa28.29■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.29■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa28.28■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 MMP14P50281 582 aa28.28■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 TTC6Q86TZ1 520 aa28.28■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 SGMS1Q86VZ5 419 aa28.28■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 SENP2Q9HC62 589 aa28.28■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28.28■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 SLC44A5Q8NCS7 719 aa28.27■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa28.27■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 UBAC1Q9BSL1 405 aa28.27■■■□□ 2.12
PAIP1-208ENST00000514514 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 SCRN1Q12765 414 aa28.26■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 SEC23AQ15436 765 aa28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 ZNF287Q9HBT7 754 aa28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 SIPA1L1O43166 1804 aa28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 ERICH2A1L162 156 aa28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 CDK8P49336 464 aa28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 GABPAQ06546 454 aa28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 WTAPQ15007 396 aa28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 DPF2Q92785 391 aa28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 MKNK2Q9HBH9 465 aa28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 HPS5Q9UPZ3 1129 aa28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 SMC3Q9UQE7 1217 aa28.25■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 TNKSO95271 1327 aa28.24■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 SHTN1A0MZ66 631 aa28.24■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 GOLGA8BA8MQT2 603 aa28.24■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 ENTPD3O75355 529 aa28.24■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 RASA1P20936 1047 aa28.24■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 FAM47AQ5JRC9 791 aa28.24■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 IQCA1Q86XH1 822 aa28.24■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 GJA3Q9Y6H8 435 aa28.24■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 TCP10Q12799 353 aa28.23■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.23■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 APOA5Q6Q788 366 aa28.23■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.23■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.23■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 TSPY2A6NKD2 308 aa28.22■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 HLA-DOAP06340 250 aa28.22■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 NFXL1Q6ZNB6 911 aa28.22■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 TMTC2Q8N394 836 aa28.22■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 EHD4Q9H223 541 aa28.22■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 CCT2P78371 535 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 TFAP4Q01664 338 aa28.21■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 SERPINB13Q9UIV8 391 aa28.21■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 ATRNL1Q5VV63 1379 aa28.21■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 MYH8P13535 1937 aa28.21■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 CCDC69A6NI79 296 aa28.21■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa28.21■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PAIP1-208ENST00000514514 CLRN2A0PK11 232 aa28.2■■■□□ 2.1
PAIP1-208ENST00000514514 GJB2P29033 226 aa28.2■■■□□ 2.1
PAIP1-208ENST00000514514 CHMP4CQ96CF2 233 aa28.2■■■□□ 2.1
PAIP1-208ENST00000514514 SWAP70Q9UH65 585 aa28.2■■■□□ 2.1
PAIP1-208ENST00000514514 NID2Q14112 1375 aa28.19■■■□□ 2.1
PAIP1-208ENST00000514514 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PAIP1-208ENST00000514514 WNT10BO00744 389 aa28.19■■■□□ 2.1
PAIP1-208ENST00000514514 NUCB2P80303 420 aa28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms