RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 PLA2G4DQ86XP0 818 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 SPAG5Q96R06 1193 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 ALS2Q96Q42 1657 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 TIMM44O43615 452 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 BCAR3O75815 825 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 FNTAP49354 379 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 ERMNQ8TAM6 284 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 FUCA2Q9BTY2 467 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 PDE11AQ9HCR9 933 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 DLC1Q96QB1 1528 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 MYO1BO43795 1136 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF8O76064 485 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 KIF4AO95239 1232 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.211e-7■□□□□ 10.6
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC7A5Q01650 507 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.211e-7■□□□□ 9.4
RABGGTB-208ENST00000471759 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM110Q86TL2 294 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 USP48Q86UV5 1035 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 SMYD1Q8NB12 490 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 PARD6BQ9BYG5 372 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 USP47Q96K76 1375 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 E2F5Q15329 346 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 GALNT15Q8N3T1 639 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 PANK1Q8TE04 598 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 DDX12PQ92771 950 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 GOLGA1Q92805 767 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 GMEB1Q9Y692 573 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 AP5Z1O43299 807 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 ZEB2O60315 1214 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 CCT5P48643 541 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP2B2Q01814 1243 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 CUL4BQ13620 913 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 PKP1Q13835 747 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 PKN1Q16512 942 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 TMC6Q7Z403 805 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 WHAMMQ8TF30 809 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 EXOC1Q9NV70 894 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 ITM2BQ9Y287 266 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-208ENST00000471759 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CARNS1A5YM72 827 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 B4DLN1 442 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNA2P16389 499 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 MCM3P25205 808 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TXLNAP40222 546 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 ADCY1Q08828 1119 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 HOMER1Q86YM7 354 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TRIM11Q96F44 468 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 MTRQ99707 1265 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-208ENST00000471759 TCHPQ9BT92 498 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.1 ms