RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
SMKR1-201ENST00000462322 PALD1Q9ULE6 856 aa29.05■■■□□ 2.24
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SMKR1-201ENST00000462322 ZHX2Q9Y6X8 837 aa29.05■■■□□ 2.24
SMKR1-201ENST00000462322 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SMKR1-201ENST00000462322 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
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SMKR1-201ENST00000462322 BTBD19C9JJ37 291 aa29.03■■■□□ 2.24
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SMKR1-201ENST00000462322 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa29.02■■■□□ 2.24
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SMKR1-201ENST00000462322 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa29.02■■■□□ 2.24
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SMKR1-201ENST00000462322 TSHZ3Q63HK5 1081 aa29■■■□□ 2.23
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SMKR1-201ENST00000462322 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
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SMKR1-201ENST00000462322 PTPRFP10586 1907 aa28.87■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 TATDN1Q6P1N9 297 aa28.87■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 EFCC1Q9HA90 598 aa28.87■■■□□ 2.21
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