RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.75■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 PPATQ06203 517 aa21.74■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.74■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 FSD1Q9BTV5 496 aa21.74■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 GTF2A2P52657 109 aa21.73■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 PPIL2Q13356 520 aa21.73■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.73■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.73■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 PICK1Q9NRD5 415 aa21.73■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 FOCADQ5VW36 1801 aa21.73■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.73■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 IRF6O14896 467 aa21.72■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 PRKAB2O43741 272 aa21.72■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 IFNL1Q8IU54 200 aa21.72■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 APPBP2Q92624 585 aa21.72■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.72■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 TTC6Q86TZ1 520 aa21.71■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 DNAJC18Q9H819 358 aa21.71■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.71■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.7■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 PTPRAP18433 802 aa21.7■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 SNAPC2Q13487 334 aa21.7■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 CCL15Q16663 113 aa21.7■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.7■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.7■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 OSBP2Q969R2 916 aa21.7■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 EVI5LQ96CN4 794 aa21.7■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.7■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 ALDH1A1P00352 501 aa21.69■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 CAP2P40123 477 aa21.69■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 PTPN18Q99952 460 aa21.69■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 EHD4Q9H223 541 aa21.69■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.69■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.69■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.69■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 SIPA1L1O43166 1804 aa21.69■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 MYH7P12883 1935 aa21.68■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 TBC1D8O95759 1140 aa21.68■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 CETPP11597 493 aa21.68■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 PLCD1P51178 756 aa21.68■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.68■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.68■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.68■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.67■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 M0R2C6 588 aa21.67■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.67■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 GPAA1O43292 621 aa21.66■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 CYP2D6P10635 497 aa21.66■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 EVX2Q03828 476 aa21.66■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.66■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.66■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 LAMB1P07942 1786 aa21.66■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 MYH1P12882 1939 aa21.65■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 CXCL11O14625 94 aa21.65■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 GDF11O95390 407 aa21.65■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 PDE4AP27815 886 aa21.65■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.65■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.65■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 RILPL2Q969X0 211 aa21.65■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.65■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 DOCK1Q14185 1865 aa21.64■■□□□ 1.06
HERC3-205ENST00000426683 JAG1P78504 1218 aa21.64■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.64■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.64■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.64■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 TRIM75PA6NK02 468 aa21.63■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 BTBD19C9JJ37 291 aa21.63■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 USP17L12C9JPN9 530 aa21.63■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 USP17L21D6R901 530 aa21.63■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 ASNSP08243 561 aa21.63■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 GNAT2P19087 354 aa21.63■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 GABPAQ06546 454 aa21.63■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 USP17L5A8MUK1 530 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 SHMT1P34896 483 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 C12orf60Q5U649 245 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC3-205ENST00000426683 GINM1Q9NU53 330 aa21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 190 ms