RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414294.6

SAE1-204, Transcript of SUMO1 activating enzyme subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene SAE1, Length 2,211 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1-204ENST00000414294 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.16■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 TNKSO95271 1327 aa22.16■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 ZBTB43O43298 467 aa22.16■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 PICALMQ13492 652 aa22.16■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.16■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.15■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.15■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 PPIP5K2O43314 1243 aa22.15■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 LIFRP42702 1097 aa22.15■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 C12orf60Q5U649 245 aa22.15■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.15■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.15■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 PHKBQ93100 1093 aa22.15■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 SBK1Q52WX2 424 aa22.14■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 SLF2Q8IX21 1173 aa22.14■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.14■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.14■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.14■■□□□ 1.14
SAE1-204ENST00000414294 GAKO14976 1311 aa22.14■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.14■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.13■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 FIBPO43427 364 aa22.13■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 USP48Q86UV5 1035 aa22.13■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 PIM2Q9P1W9 311 aa22.13■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 FLT1P17948 1338 aa22.13■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 FGRP09769 529 aa22.12■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 PDE4BQ07343 736 aa22.12■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.12■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.12■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 SEC23AQ15436 765 aa22.12■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.12■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 GPT2Q8TD30 523 aa22.12■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 AIFM3Q96NN9 605 aa22.12■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 TSPY2A6NKD2 308 aa22.11■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 DACT2Q5SW24 774 aa22.11■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.11■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 TCHHQ07283 1943 aa22.11■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 YDJCA8MPS7 323 aa22.11■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 IQCA1Q86XH1 822 aa22.11■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 USP40Q9NVE5 1235 aa22.11■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 SNED1Q8TER0 1413 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 USP17L3A6NCW0 530 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 USP17L4A6NCW7 530 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 IGSF3O75054 1194 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 CCDC93Q567U6 631 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 PLCG2P16885 1265 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 CACNB3P54284 484 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 TFAP4Q01664 338 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 SCN9AQ15858 1988 aa22.1■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 ORC4O43929 436 aa22.09■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 CRKP46108 304 aa22.09■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.09■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 TEKT1Q969V4 418 aa22.09■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 PTMSP20962 102 aa22.08■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.08■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 RAD17O75943 681 aa22.08■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 NTRK3Q16288 839 aa22.08■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.08■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 TMTC2Q8N394 836 aa22.08■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SAE1-204ENST00000414294 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SAE1-204ENST00000414294 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.07■■□□□ 1.12
SAE1-204ENST00000414294 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.07■■□□□ 1.12
SAE1-204ENST00000414294 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.07■■□□□ 1.12
SAE1-204ENST00000414294 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.07■■□□□ 1.12
SAE1-204ENST00000414294 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.07■■□□□ 1.12
SAE1-204ENST00000414294 KIF3AQ9Y496 699 aa22.07■■□□□ 1.12
SAE1-204ENST00000414294 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms