RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399207.5

SETD4-204, Transcript of SET domain containing 4, human

TSL 3 BASIC

Gene SETD4, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SETD4-204	ENST00000399207	PTPN18	Q99952	460 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	GOLIM4	O00461	696 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SETD4-204	ENST00000399207	CXCL11	O14625	94 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	USP5	P45974	858 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	CRHR2	Q13324	411 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.27	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	FLT1	P17948	1338 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	PTPRA	P18433	802 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	AAMP	Q13685	434 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	HAUS7	Q99871	368 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	PDE6A	P16499	860 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	SP3	Q02447	781 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	CAP2	P40123	477 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	MYH1	P12882	1939 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	PDHX	O00330	501 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	TLR2	O60603	784 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	ERC2	O15083	957 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	ASNS	P08243	561 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	ADD2	P35612	726 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	KIF22	Q14807	665 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SETD4-204	ENST00000399207	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SETD4-204	ENST00000399207	MYH7	P12883	1935 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SETD4-204	ENST00000399207	SPP2	Q13103	211 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SETD4-204	ENST00000399207	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SETD4-204	ENST00000399207	MOGS	Q13724	837 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SETD4-204	ENST00000399207	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SETD4-204	ENST00000399207	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SETD4-204	ENST00000399207	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SETD4-204	ENST00000399207	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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