RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378863.8

CRLS1-201, Transcript of cardiolipin synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRLS1, Length 3,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1-201ENST00000378863 KCNH3Q9ULD8 1083 aa16.78■□□□□ 0.28
CRLS1-201ENST00000378863 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.78■□□□□ 0.28
CRLS1-201ENST00000378863 KRT18P05783 430 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
CRLS1-201ENST00000378863 LDHCP07864 332 aa16.77■□□□□ 0.28
CRLS1-201ENST00000378863 UBA7P41226 1012 aa16.77■□□□□ 0.28
CRLS1-201ENST00000378863 GNG11P61952 73 aa16.77■□□□□ 0.28
CRLS1-201ENST00000378863 TMTC2Q8N394 836 aa16.77■□□□□ 0.28
CRLS1-201ENST00000378863 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa16.77■□□□□ 0.28
CRLS1-201ENST00000378863 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CRLS1-201ENST00000378863 CEP131Q9UPN4 1083 aa16.77■□□□□ 0.28
CRLS1-201ENST00000378863 BRAPQ7Z569 592 aa16.77■□□□□ 0.28
CRLS1-201ENST00000378863 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
CRLS1-201ENST00000378863 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
CRLS1-201ENST00000378863 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.77■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 MED23Q9ULK4 1368 aa16.77■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 CAVIN2O95810 425 aa16.77■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 NAPAP54920 295 aa16.77■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 DPCR1Q3MIW9 517 aa16.77■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.77■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.77■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 KIF5BP33176 963 aa16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 MYRIPQ8NFW9 859 aa16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 GSDMDP57764 484 aa16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 KARSQ15046 597 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 BCL2L12Q9HB09 334 aa16.76■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 APBA3O96018 575 aa16.75■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 GUCY1A2P33402 732 aa16.75■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.75■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 GGA1Q9UJY5 639 aa16.75■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 MECOMQ03112 1051 aa16.75■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 LETM2Q2VYF4 491 aa16.75■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 DACH1Q9UI36 760 aa16.75■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 COL15A1P39059 1388 aa16.75■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 CAMTA2O94983 1202 aa16.75■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 CASP1P29466 404 aa16.75■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.75■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 FAM170AA1A519 330 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 CTDNEP1O95476 244 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 CSF1RP07333 972 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 KIAA0825Q8IV33 1275 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 CPDO75976 1380 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 DEXIO95424 95 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 KRT2P35908 639 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 FBXO3Q9UK99 471 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 PXDNLA1KZ92 1463 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 KIAA1468Q9P260 1216 aa16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 USP17L3A6NCW0 530 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 USP17L4A6NCW7 530 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 KIF28PB7ZC32 967 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 PLEKHA8P1O95397 391 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 TNNI2P48788 182 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 ANTXR2P58335 489 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 RRAGBQ5VZM2 374 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 TMEM87AQ8NBN3 555 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 SERTAD1Q9UHV2 236 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 ZMYM6O95789 1325 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 FANCCQ00597 558 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 ADALQ6DHV7 355 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 LRP10Q7Z4F1 713 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 ZNF34Q8IZ26 560 aa16.73■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 CACNB3P54284 484 aa16.72■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.72■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 NEMFO60524 1076 aa16.72■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 DNA2P51530 1060 aa16.72■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 CCDC178Q5BJE1 867 aa16.72■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 TRERF1Q96PN7 1200 aa16.72■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 UBE4AQ14139 1066 aa16.72■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 NFIXQ14938 502 aa16.72■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 NOSTRINQ8IVI9 506 aa16.72■□□□□ 0.27
CRLS1-201ENST00000378863 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms