RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF213O14771 459 aa35.15■■■■□ 3.22
ECHS1-201ENST00000368547 STK11IPQ8N1F8 1099 aa35.14■■■■□ 3.22
ECHS1-201ENST00000368547 CDCA5Q96FF9 252 aa35.14■■■■□ 3.22
ECHS1-201ENST00000368547 CYP21A2P08686 494 aa35.13■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 SLURP2P0DP57 97 aa35.13■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 CTDSPL2Q05D32 466 aa35.13■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 DYNLL2Q96FJ2 89 aa35.13■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 EHD4Q9H223 541 aa35.13■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINB13Q9UIV8 391 aa35.13■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 ANAPC4Q9UJX5 808 aa35.13■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 TRAF5O00463 557 aa35.12■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 CREB3L3Q68CJ9 461 aa35.12■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF3Q9H094 633 aa35.12■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 ROBO3Q96MS0 1386 aa35.11■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 SLC27A2O14975 620 aa35.11■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa35.11■■■■□ 3.21
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ECHS1-201ENST00000368547 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 SSC5DA1L4H1 1573 aa35.11■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 HSPA4P34932 840 aa35.1■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 MIGA2Q7L4E1 593 aa35.1■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 FAM196BA6NMK8 535 aa35.1■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 TOMM70O94826 608 aa35.09■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 GABPAQ06546 454 aa35.09■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP35.09■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 RNF20Q5VTR2 975 aa35.09■■■■□ 3.21
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ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D10CQ8IV04 446 aa35.09■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 HOOK2Q96ED9 719 aa35.09■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM34Q9BYJ4 488 aa35.09■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 MYH8P13535 1937 aa35.08■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC18Q9H819 358 aa35.08■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 TAF6LQ9Y6J9 622 aa35.08■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 C16orf86Q6ZW13 317 aa35.07■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 SLC44A5Q8NCS7 719 aa35.07■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 SMC1BQ8NDV3 1235 aa35.07■■■■□ 3.21
ECHS1-201ENST00000368547 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP35.07■■■■□ 3.213e-10■■■■■ 29.1
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ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D12O60347 775 aa35.06■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 NF2P35240 595 aa35.06■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 MAP3K10Q02779 954 aa35.06■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 TACC3Q9Y6A5 838 aa35.06■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 CDK8P49336 464 aa35.05■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 AKNAD1Q5T1N1 836 aa35.05■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 DCAF15Q66K64 600 aa35.05■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 RASEFQ8IZ41 740 aa35.05■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 SWAP70Q9UH65 585 aa35.05■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 PDE4BQ07343 736 aa35.04■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 STAG1Q8WVM7 1258 aa35.04■■■■□ 3.2
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ECHS1-201ENST00000368547 FZD1Q9UP38 647 aa35.04■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF408Q9H9D4 720 aa35.03■■■■□ 3.2
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ECHS1-201ENST00000368547 SHMT1P34896 483 aa35.03■■■■□ 3.2
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ECHS1-201ENST00000368547 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 MKNK2Q9HBH9 465 aa35.03■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 TAOK2Q9UL54 1235 aa35.03■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 TRPM7Q96QT4 1865 aa35.02■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP35.02■■■■□ 3.2
ECHS1-201ENST00000368547 E7EWF7 191 aa35.01■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 FGRP09769 529 aa35.01■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 STOX1Q6ZVD7 989 aa35.01■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF287Q9HBT7 754 aa35.01■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 TOMM22Q9NS69 142 aa35.01■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 SNX14Q9Y5W7 946 aa35.01■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 NEDD4P46934 1319 aa35■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 TATDN1Q6P1N9 297 aa35■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF341Q9BYN7 854 aa35■■■■□ 3.19
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ECHS1-201ENST00000368547 PCP11498 1178 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 TSGA10IPQ3SY00 556 aa34.99■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
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ECHS1-201ENST00000368547 USP2O75604 605 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 CELF2O95319 508 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 PASKQ96RG2 1323 aa34.97■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 PHF20L1A8MW92 1017 aa34.97■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 RASA1P20936 1047 aa34.97■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 KLRG1Q96E93 195 aa34.96■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 CNNM2Q9H8M5 875 aa34.96■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 FSTL1Q12841 308 aa34.95■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 TRDNQ13061 729 aa34.95■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 KRT32Q14532 448 aa34.95■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 ADCK5Q3MIX3 580 aa34.95■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 WRNIP1Q96S55 665 aa34.95■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 KIF2CQ99661 725 aa34.95■■■■□ 3.19
ECHS1-201ENST00000368547 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
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