RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 C21orf2O43822 256 aa24.66■■□□□ 1.54
OPN3-201ENST00000366554 POSTNQ15063 836 aa24.66■■□□□ 1.54
OPN3-201ENST00000366554 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.66■■□□□ 1.54
OPN3-201ENST00000366554 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.65■■□□□ 1.54
OPN3-201ENST00000366554 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
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OPN3-201ENST00000366554 ZNF827Q17R98 1081 aa24.65■■□□□ 1.54
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OPN3-201ENST00000366554 GBP6Q6ZN66 633 aa24.63■■□□□ 1.53
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OPN3-201ENST00000366554 CAPN7Q9Y6W3 813 aa24.62■■□□□ 1.53
OPN3-201ENST00000366554 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
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OPN3-201ENST00000366554 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.62■■□□□ 1.53
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OPN3-201ENST00000366554 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.61■■□□□ 1.53
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OPN3-201ENST00000366554 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
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OPN3-201ENST00000366554 GOLIM4O00461 696 aa24.6■■□□□ 1.53
OPN3-201ENST00000366554 PRC1O43663 620 aa24.6■■□□□ 1.53
OPN3-201ENST00000366554 GNGT1P63211 74 aa24.6■■□□□ 1.53
OPN3-201ENST00000366554 TICAM2Q86XR7 235 aa24.6■■□□□ 1.53
OPN3-201ENST00000366554 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.6■■□□□ 1.53
OPN3-201ENST00000366554 ALG1Q9BT22 464 aa24.6■■□□□ 1.53
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OPN3-201ENST00000366554 MYO1FO00160 1098 aa24.59■■□□□ 1.53
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OPN3-201ENST00000366554 ZMYM6O95789 1325 aa24.59■■□□□ 1.53
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OPN3-201ENST00000366554 ZMYND10O75800 440 aa24.58■■□□□ 1.53
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OPN3-201ENST00000366554 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
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OPN3-201ENST00000366554 SAMM50Q9Y512 469 aa24.58■■□□□ 1.53
OPN3-201ENST00000366554 CDKAL1Q5VV42 579 aa24.58■■□□□ 1.52
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OPN3-201ENST00000366554 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.58■■□□□ 1.52
OPN3-201ENST00000366554 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.58■■□□□ 1.52
OPN3-201ENST00000366554 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.57■■□□□ 1.52
OPN3-201ENST00000366554 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.57■■□□□ 1.52
OPN3-201ENST00000366554 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.57■■□□□ 1.52
OPN3-201ENST00000366554 ANTXR2P58335 489 aa24.57■■□□□ 1.52
OPN3-201ENST00000366554 NEDD9Q14511 834 aa24.57■■□□□ 1.52
OPN3-201ENST00000366554 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24.57■■□□□ 1.52
OPN3-201ENST00000366554 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
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