RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339098.9

CERKL-201, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CERKL, Length 1,677 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-201ENST00000339098 EHD4Q9H223 541 aa24.15■■□□□ 1.46
CERKL-201ENST00000339098 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.15■■□□□ 1.46
CERKL-201ENST00000339098 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.14■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 SLC27A2O14975 620 aa24.14■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.14■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 GABPAQ06546 454 aa24.13■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.13■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.13■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 MYH8P13535 1937 aa24.13■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 SLURP2P0DP57 97 aa24.12■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 MAP3K10Q02779 954 aa24.12■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 RNF20Q5VTR2 975 aa24.12■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 KCNB2Q92953 911 aa24.12■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.11■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.11■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.11■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 CDCA5Q96FF9 252 aa24.11■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 DNAJC18Q9H819 358 aa24.11■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 TBC1D12O60347 775 aa24.11■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 RASEFQ8IZ41 740 aa24.11■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.11■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.11■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.11■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 TRAF5O00463 557 aa24.1■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 FGRP09769 529 aa24.1■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.1■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.1■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.1■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.1■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 HOOK2Q96ED9 719 aa24.1■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 INCENPQ9NQS7 918 aa24.1■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.1■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 FAM196BA6NMK8 535 aa24.09■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 MCCP23508 829 aa24.09■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.09■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 TOMM70O94826 608 aa24.08■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 CDK8P49336 464 aa24.08■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
CERKL-201ENST00000339098 SHMT1P34896 483 aa24.08■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 PDE4BQ07343 736 aa24.08■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.08■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.08■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.08■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 SWAP70Q9UH65 585 aa24.08■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.08■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.07■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 E7EWF7 191 aa24.07■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.07■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.07■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 PRDM1O75626 825 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 DCAF15Q66K64 600 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 NEDD4P46934 1319 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 ORC4O43929 436 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 NF2P35240 595 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 ANAPC15P60006 121 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 FZD1Q9UP38 647 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 RASA1P20936 1047 aa24.04■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 KRT32Q14532 448 aa24.04■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.04■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 IL17RAQ96F46 866 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 TOMM22Q9NS69 142 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 KLRG1Q96E93 195 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 KRT23Q9C075 422 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 PASKQ96RG2 1323 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 B4E1Z4 1266 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 TRDNQ13061 729 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 PRKG1Q13976 671 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 NCOA7Q8NI08 942 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-201ENST00000339098 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.01■■□□□ 1.43
CERKL-201ENST00000339098 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.01■■□□□ 1.43
CERKL-201ENST00000339098 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 216 ms