RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 TMEM87BQ96K49 555 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 MTA3Q9BTC8 594 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.05■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 SHTN1A0MZ66 631 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 TCP10Q12799 353 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 CHST3Q7LGC8 479 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.04■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 CLRN2A0PK11 232 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 SMIM22K7EJ46 135 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 TMX3Q96JJ7 454 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.03■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 PRDM1O75626 825 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 ANTXR2P58335 489 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM151AQ8WW52 585 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 VEZTQ9HBM0 779 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 SWAP70Q9UH65 585 aa23.02■■□□□ 1.28
VSTM2B-201ENST00000335523 ERICH2A1L162 156 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TNNI2P48788 182 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 CDK8P49336 464 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 EVX2Q03828 476 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM83AQ86UY5 434 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 BRF1Q92994 677 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 EHD4Q9H223 541 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 LAMA4Q16363 1823 aa23.01■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 IQCA1Q86XH1 822 aa23■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TMTC2Q8N394 836 aa23■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 UBAC1Q9BSL1 405 aa23■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TNFAIP1Q13829 316 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TSPY2A6NKD2 308 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 GABPAQ06546 454 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 EPS15P42566 896 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 LIFRP42702 1097 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TFAP4Q01664 338 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 EGFRP00533 1210 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 EVCP57679 992 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 CUL4AQ13619 759 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TSPY3P0CV98 308 aa22.96■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TSPY8P0CW00 308 aa22.96■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 RASA1P20936 1047 aa22.96■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 APOBRQ0VD83 1088 aa22.96■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 WTAPQ15007 396 aa22.96■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 ME3Q16798 604 aa22.96■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.96■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.96■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 CSRNP1Q96S65 589 aa22.96■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
VSTM2B-201ENST00000335523 GLTPD2A6NH11 291 aa22.95■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms