RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 IFNAR1P17181 557 aa20.39■□□□□ 0.86
SPNS1-202ENST00000323081 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.86
SPNS1-202ENST00000323081 SARM1Q6SZW1 724 aa20.39■□□□□ 0.86
SPNS1-202ENST00000323081 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.39■□□□□ 0.86
SPNS1-202ENST00000323081 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.39■□□□□ 0.86
SPNS1-202ENST00000323081 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
SPNS1-202ENST00000323081 PFKFB1P16118 471 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 RTN1Q16799 776 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 SMIM22K7EJ46 135 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 TMTC2Q8N394 836 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 WASF1Q92558 559 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 TM4SF1P30408 202 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 MTA3Q9BTC8 594 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 CDC25BP30305 580 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 GUCY1A2P33402 732 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 PTPAQ15257 358 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 JMYQ8N9B5 988 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 MAP3K14Q99558 947 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 NID2Q14112 1375 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 PPP6R2O75170 966 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 SEMA3EO15041 775 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 LRMPQ12912 555 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 ESR2Q92731 530 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 FANCBQ8NB91 859 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 EP400Q96L91 3159 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 BTBD18B2RXH4 712 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 BIN1O00499 593 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 MMP1P03956 469 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 SYKP43405 635 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 SHC4Q6S5L8 630 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 NBPF11Q86T75 865 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 TNKSO95271 1327 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-202ENST00000323081 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 DEXIO95424 95 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 RFC4P35249 363 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 RCAN1P53805 252 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 SLC51AQ86UW1 340 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 TIGD1Q96MW7 591 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 CLIC6Q96NY7 704 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 HPSEQ9Y251 543 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 MECOMQ03112 1051 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 SEC23AQ15436 765 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 NLRP12P59046 1061 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 PRDX5P30044 214 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 NFIXQ14938 502 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 RESP18Q5W5W9 173 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 ZMYND15Q9H091 742 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 CUTAO60888 179 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 AFF2P51816 1311 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 PRDM1O75626 825 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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