RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299240.10

TTC17-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC17, Length 3,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-202ENST00000299240 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 BIN1O00499 593 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 GNAT2P19087 354 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 LY9Q9HBG7 655 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 DACT1Q9NYF0 836 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 BTBD18B2RXH4 712 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 KIF3AQ9Y496 699 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 ECE2O60344 883 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 LDHCP07864 332 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 A0A1B0GVL5 298 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 GDF11O95390 407 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 KCNB2Q92953 911 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 KAT14Q9H8E8 782 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 CRY2Q49AN0 593 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 FBXO41Q8TF61 875 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 SNAP25P60880 206 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 SP8Q8IXZ3 490 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 FAM205CA6NFA0 338 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 KRT40Q6A162 431 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 CLIC4Q9Y696 253 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 SHTN1A0MZ66 631 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 KIF28PB7ZC32 967 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC17-202ENST00000299240 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 FANCBQ8NB91 859 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 FZD1Q9UP38 647 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 TTLL6Q8N841 843 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 OXER1Q8TDS5 423 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 SDF4Q9BRK5 362 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 PAPPAQ13219 1627 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 EYA3Q99504 573 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 CABP5Q9NP86 173 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 SLC16A2P36021 539 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 CCDC96Q2M329 555 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 CLIC6Q96NY7 704 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 GSTO1P78417 241 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 NBPF11Q86T75 865 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 RBSNQ9H1K0 784 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 NR1I2O75469 434 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 TEKT1Q969V4 418 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 SPEF2Q9C093 1822 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 POLD1P28340 1107 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 FSIP1Q8NA03 581 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 PNMA1Q8ND90 353 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 CNKSR1Q969H4 720 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 TMEM87BQ96K49 555 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC17-202ENST00000299240 PLIN2Q99541 437 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms