RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16■□□□□ 0.15
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PTPRO-201ENST00000281171 CALM1P0DP23 149 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 CALM2P0DP24 149 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 CALM3P0DP25 149 aa16■□□□□ 0.15
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PTPRO-201ENST00000281171 CENPKQ9BS16 269 aa16■□□□□ 0.15
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PTPRO-201ENST00000281171 KRT71Q3SY84 523 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTPRO-201ENST00000281171 BRD1O95696 1058 aa15.97■□□□□ 0.15
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PTPRO-201ENST00000281171 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.97■□□□□ 0.15
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PTPRO-201ENST00000281171 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.97■□□□□ 0.15
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PTPRO-201ENST00000281171 SCINQ9Y6U3 715 aa15.96■□□□□ 0.15
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PTPRO-201ENST00000281171 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRO-201ENST00000281171 AK2P54819 239 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRO-201ENST00000281171 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRO-201ENST00000281171 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRO-201ENST00000281171 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRO-201ENST00000281171 RTL9Q8NET4 1388 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRO-201ENST00000281171 PCYT1AP49585 367 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRO-201ENST00000281171 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.95■□□□□ 0.14
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