RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262305.8

RAB11FIP3-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP3, Length 4,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NLRP12P59046 1061 aa24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PTCH1Q13635 1447 aa24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RASEFQ8IZ41 740 aa24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRAF5O00463 557 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CHRNDQ07001 517 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TXKP42681 527 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FANCCQ00597 558 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TUBB4BP68371 445 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ADALQ6DHV7 355 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 IMPG2Q9BZV3 1241 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CTNND2Q9UQB3 1225 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ADCY7P51828 1080 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ATG3Q9NT62 314 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PHKA1P46020 1223 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZNF75DP51815 510 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 UBE4AQ14139 1066 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SYT10Q6XYQ8 523 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GOLGA1Q92805 767 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ADCY9O60503 1353 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRIM14Q14142 442 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 POSTNQ15063 836 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ADORA1P30542 326 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FANCBQ8NB91 859 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KRT222Q8N1A0 295 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 USP28Q96RU2 1077 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ATP2B4P23634 1241 aa24.58■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GTF2IP78347 998 aa24.58■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 VPS16Q9H269 839 aa24.58■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa24.58■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZMYM6O95789 1325 aa24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PAK1Q13153 545 aa24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PKP1Q13835 747 aa24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TNKSO95271 1327 aa24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 POLA2Q14181 598 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FMNL3Q8IVF7 1028 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CCDC91Q7Z6B0 441 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BACH1O14867 736 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ACTN2P35609 894 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GLI2P10070 1586 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.523e-6■□□□□ 9.3
RAB11FIP3-201ENST00000262305 V9GYY5 206 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CYP21A2P08686 494 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 HSF2BPO75031 334 aa24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SYNCQ9H7C4 482 aa24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 APBA3O96018 575 aa24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TEKT1Q969V4 418 aa24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 STK24Q9Y6E0 443 aa24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PDE6BP35913 854 aa24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TCP10Q12799 353 aa24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms