RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391293.1

5S_rRNA.2-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 112 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 LINC01554Q52M75 96 aa0.39□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 C1orf146Q5VVC0 180 aa0.39□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SMIM15Q7Z3B0 74 aa0.39□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 BAGE2Q86Y30 109 aa0.39□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 AMN1Q8IY45 258 aa0.39□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SMIM2Q9BVW6 85 aa0.39□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TNFSF18Q9UNG2 199 aa0.39□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa0.38□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RAB4AP20338 218 aa0.38□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 Q6JHZ5 121 aa0.38□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MCFD2Q8NI22 146 aa0.38□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 STOML3Q8TAV4 291 aa0.38□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SMIM4Q8WVI0 70 aa0.38□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TCEAL7Q9BRU2 100 aa0.38□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 VCXQ9H320 206 aa0.38□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 VCX2Q9H322 139 aa0.38□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SS18L2Q9UHA2 77 aa0.38□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 R4GN34 69 aa0.38□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa0.37□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SCO2A0A1W2PP80 73 aa0.37□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZNF815PA8K554 130 aa0.37□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 M0QZ58 72 aa0.37□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ATP6V1G2O95670 118 aa0.37□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 Q5BKY6 102 aa0.37□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ADM2Q7Z4H4 148 aa0.37□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa0.37□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ENKURQ8TC29 256 aa0.37□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 A0A1W2PPM0 123 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 IGIPA6NJ69 53 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FAM25AB3EWG3 89 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FAM25CB3EWG5 89 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FAM25GB3EWG6 89 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TEX46H3BTG2 121 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PPP1R17O96001 155 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 S100A9P06702 114 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 IL15RAQ13261 267 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZNF726P1Q15940 193 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 S100A7L2Q5SY68 101 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SFT2D1Q8WV19 159 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ANAPC16Q96DE5 110 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 C20orf78Q9BR46 151 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CST9LQ9H4G1 147 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TPRKBQ9Y3C4 175 aa0.36□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 IGKV2-30P06310 120 aa0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 IGKV4-1P06312 121 aa0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SMIM13P0DJ93 91 aa0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 VBP1P61758 197 aa0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CENPWQ5EE01 88 aa0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 LYRM7Q5U5X0 104 aa0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CST9LP1Q5W188 147 aa0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 LINC00518Q8N0U6 118 aa0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SCGB1C1Q8TD33 95 aa0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SMIM3Q9BZL3 60 aa0.35□□□□□ -2.35
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CCDC160A6NGH7 325 aa0.34□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 H2AFB2P0C5Z0 115 aa0.34□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 COX7BP24311 80 aa0.34□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa0.34□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SFTA2Q6UW10 78 aa0.34□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CYSLTR1Q9Y271 337 aa0.34□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 A0A087WVE0 104 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 HMSDA8MTL9 139 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 C8orf87E5RJ46 101 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 H0YIZ8 118 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 H3BRM9 83 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 H3BUT2 72 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PAGE4O60829 102 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ATP6V1G1O75348 118 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NDUFB6O95139 128 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NPYP01303 97 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ATP6V0CP27449 155 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RPL23P62829 140 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 OCIAD2Q56VL3 154 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 C7orf65Q6ZTY9 151 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 HSPB11Q9Y547 144 aa0.33□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa0.32□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 A0A1B0GVX0 72 aa0.32□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PLA2G10O15496 165 aa0.32□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NDUFC2O95298 119 aa0.32□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FAUP35544 74 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 LSM3P62310 102 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 DEFB116Q30KQ4 102 aa0.32□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa0.32□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.31□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 A0A1B0GUT8 65 aa0.31□□□□□ -2.36
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TMEM223A0PJW6 202 aa0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141 ms