RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF345	Q14585	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	PPBP	P02775	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	CEBPG	P53567	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337		V9GYV3	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337		B5MCH6	92 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	COX17	Q14061	63 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q9BRP9	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A1B0GW15	77 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	NCR3	O14931	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337		F8W036	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337		H7C2G1	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q8N8P6	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	S100A8	P05109	93 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q6ZRX8	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337		H3BRM9	83 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC00158	P58513	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	S100A12	P80511	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A0U1RRA0	63 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A1B0GXF2	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	CD164	Q04900	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	PMVK	Q15126	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q75L30	129 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q5XG85	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337		K7EMI3	77 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	G0S2	P27469	103 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q1RN00	199 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	DDT	P30046	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	ADIRF	Q15847	76 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPRR1B	P22528	89 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPTAN1-231	ENST00000636337	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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